计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 647|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 通过gaussian进行限制性优化后没有虚频,但是拿输出结构进行优化,结构改变

[复制链接 Copy URL]

2

帖子

0

威望

53

eV
积分
55

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 wuxzd 于 2023-11-23 14:58 编辑

限制性优化的输入文件在下面


#p opt=modredundant freq 6-311g(d,p) pop=nbo empiricaldispersion=gd3 pbe1pbe


123


0 1
C                  0.10145500   -0.73671300   -0.20876200
C                 -0.72966700   -1.61989200    0.49329100
C                 -0.52069500   -2.98769400    0.43617700
C                  0.52069500   -3.51718800   -0.32699000
C                  1.34552300   -2.64934500   -1.04091600
C                  1.13432700   -1.28290000   -0.96825100
C                 -0.52069500    3.51718800   -0.32699000
C                 -1.34552300    2.64934500   -1.04091600
C                 -1.13432700    1.28290000   -0.96825100
C                  0.72966700    1.61989200    0.49329100
C                  0.52069500    2.98769400    0.43617700
C                 -0.10145500    0.73671300   -0.20876200
N                 -0.67483200    4.90146300   -0.33974100
N                  0.67483200   -4.90146300   -0.33974100
C                  1.72955500   -5.59322700   -0.76690300
C                  1.79443700   -6.97611000   -0.77239500
C                  0.65980200   -7.77930800   -0.29637400
O                 -0.39203900   -7.26409200    0.13195600
C                 -1.72955500    5.59322700   -0.76690300
C                 -1.79443700    6.97611000   -0.77239500
C                 -0.65980200    7.77930800   -0.29637400
O                  0.39203900    7.26409200    0.13195600
C                  2.98373800   -7.61339900   -1.24112100
C                  3.09112400   -8.96735100   -1.26590200
C                  1.99598400   -9.76311200   -0.81365200
C                  0.84176000   -9.21015000   -0.35362500
C                 -2.98373800    7.61339900   -1.24112100
C                 -3.09112400    8.96735100   -1.26590200
C                 -1.99598400    9.76311200   -0.81365200
C                 -0.84176000    9.21015000   -0.35362500
C                 -1.86590000   -1.10299500    1.33594000
F                 -2.40416400   -2.06574800    2.09520500
F                 -2.86009800   -0.61247300    0.57123700
F                 -1.47942400   -0.12041200    2.15611200
C                  1.86590000    1.10299500    1.33594000
F                  2.40416400    2.06574800    2.09520500
F                  2.86009800    0.61247300    0.57123700
F                  1.47942400    0.12041200    2.15611200
H                 -1.16030700   -3.65391600    1.00312300
H                  2.14186400   -3.02729900   -1.67095300
H                  1.78323400   -0.61467200   -1.52189800
H                 -2.14186400    3.02729900   -1.67095300
H                 -1.78323400    0.61467200   -1.52189800
H                  1.16030700    3.65391600    1.00312300
H                  0.08249100    5.50502700    0.01376500
H                 -0.08249100   -5.50502700    0.01376500
H                  2.58666000   -5.02223100   -1.11469400
H                 -2.58666000    5.02223100   -1.11469400
H                  3.80626600   -6.98882400   -1.58137800
H                  3.99465400   -9.44667700   -1.62369500
H                  2.09349700  -10.84488000   -0.83914100
H                  0.01178800   -9.81650900   -0.00868000
H                 -3.80626600    6.98882400   -1.58137800
H                 -3.99465400    9.44667700   -1.62369500
H                 -2.09349700   10.84488000   -0.83914100
H                 -0.01178800    9.81650900   -0.00868000


B 18 46 F
B 22 45 F




得到的结果没有虚频,然后在输出文件的基础上进行了先限制性优化,得到的结果却出现了虚频,这该怎么办呢,我想要得到的是限制性优化的结构,因为和势能面扫描的结果吻合



这是第二次优化的输入文件信息:
#p opt freq 6-311g(d,p) empiricaldispersion=gd3 pbe1pbe

456

0 1
C                  0.10145500   -0.73671300   -0.20876200
C                 -0.72966700   -1.61989200    0.49329100
C                 -0.52069500   -2.98769400    0.43617700
C                  0.52069500   -3.51718800   -0.32699000
C                  1.34552300   -2.64934500   -1.04091600
C                  1.13432700   -1.28290000   -0.96825100
C                 -0.52069500    3.51718800   -0.32699000
C                 -1.34552300    2.64934500   -1.04091600
C                 -1.13432700    1.28290000   -0.96825100
C                  0.72966700    1.61989200    0.49329100
C                  0.52069500    2.98769400    0.43617700
C                 -0.10145500    0.73671300   -0.20876200
N                 -0.67483200    4.90146300   -0.33974100
N                  0.67483200   -4.90146300   -0.33974100
C                  1.72955500   -5.59322700   -0.76690300
C                  1.79443700   -6.97611000   -0.77239500
C                  0.65980200   -7.77930800   -0.29637400
O                 -0.39203900   -7.26409200    0.13195600
C                 -1.72955500    5.59322700   -0.76690300
C                 -1.79443700    6.97611000   -0.77239500
C                 -0.65980200    7.77930800   -0.29637400
O                  0.39203900    7.26409200    0.13195600
C                  2.98373800   -7.61339900   -1.24112100
C                  3.09112400   -8.96735100   -1.26590200
C                  1.99598400   -9.76311200   -0.81365200
C                  0.84176000   -9.21015000   -0.35362500
C                 -2.98373800    7.61339900   -1.24112100
C                 -3.09112400    8.96735100   -1.26590200
C                 -1.99598400    9.76311200   -0.81365200
C                 -0.84176000    9.21015000   -0.35362500
C                 -1.86590000   -1.10299500    1.33594000
F                 -2.40416400   -2.06574800    2.09520500
F                 -2.86009800   -0.61247300    0.57123700
F                 -1.47942400   -0.12041200    2.15611200
C                  1.86590000    1.10299500    1.33594000
F                  2.40416400    2.06574800    2.09520500
F                  2.86009800    0.61247300    0.57123700
F                  1.47942400    0.12041200    2.15611200
H                 -1.16030700   -3.65391600    1.00312300
H                  2.14186400   -3.02729900   -1.67095300
H                  1.78323400   -0.61467200   -1.52189800
H                 -2.14186400    3.02729900   -1.67095300
H                 -1.78323400    0.61467200   -1.52189800
H                  1.16030700    3.65391600    1.00312300
H                  0.08249100    5.50502700    0.01376500
H                 -0.08249100   -5.50502700    0.01376500
H                  2.58666000   -5.02223100   -1.11469400
H                 -2.58666000    5.02223100   -1.11469400
H                  3.80626600   -6.98882400   -1.58137800
H                  3.99465400   -9.44667700   -1.62369500
H                  2.09349700  -10.84488000   -0.83914100
H                  0.01178800   -9.81650900   -0.00868000
H                 -3.80626600    6.98882400   -1.58137800
H                 -3.99465400    9.44667700   -1.62369500
H                 -2.09349700   10.84488000   -0.83914100
H                 -0.01178800    9.81650900   -0.00868000


3806

帖子

4

威望

7996

eV
积分
11882

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2023-11-23 15:03:46 | 只看该作者 Only view this author
你第一个任务得到的不是真正的极小点,是坐标限制下的极小点,“没有虚频”也是假象,是程序把坐标限制考虑进去了。你放开坐标限制之后,首先结构的力不为零,你直接算freq看有无虚频意义不大,此时热力学量也没有意义。放开限制后,它结构就是应该会变化,不会变化才是奇怪的(除非运气特别好,做了一个没有用的坐标限制,可以落到真正极小点)。

“和势能面扫描的结果吻合”这话比较模糊,不知道想讲什么。

自动做多参考态计算的程序MOKIT

2

帖子

0

威望

53

eV
积分
55

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-23 15:28:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wuxzd 于 2023-11-23 15:32 编辑
zjxitcc 发表于 2023-11-23 15:03
你第一个任务得到的不是真正的极小点,是坐标限制下的极小点,“没有虚频”也是假象,是程序把坐标限制考虑 ...

哦哦哦好的理解了,势能面扫描是我对结构里的两个氢键距离进行了刚性扫描,但是结果显示能量最低的点O-H的距离是1.79左右,但是我实际上优化的结果是1.59左右,我不知道怎么解释这种现象,所以试了下限制性优化

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 00:04 , Processed in 0.918600 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list