求助：NPT系综压力波动

luogaoyang123 · 发表于 Post on 2024-1-4 16:55:38

本帖最后由 luogaoyang123 于 2024-1-5 10:05 编辑

各位老师好！
最近投了一篇文章，审稿人提问：Could you elaborate on the rationale behindthe choice of damping coefficients for the Nosé-Hoover and Berendsen thermostats and barostats inmaintaining temperature and pressure within the system?
现在我输出了弛豫时的一个温度、压力、密度、能量的变化，期中压力变化设置为1atm，图中波动为上下1000atm，阻尼系数参考文献控压用的1000，本来想用图说明设置的值符合体系，但现在压力波动严重，请问这样的情况正常吗？怎么回审稿人对控压原理的提问？

Huschein · 发表于 Post on 2024-1-4 17:08:00

1.下次传图片就直接传那些可以直接显示的，不能直接显示的很少有人会为你下载下来看
2.做一条average的line，只要不偏离1太多即是合理
3.可以从模拟体系的设置角度向审稿人说明为什么波动这么大（1.找几篇参数和你差不多的 2.从建模角度，比如盒子本来就很小，一点点小的波动就实际上变化很大等等）
4.他要你解释原理，那你可能要去看NH和Berendsen的原文，然后去讲为什么这么设置

luogaoyang123 · 发表于 Post on 2024-1-5 08:44:30

Huschein 发表于 2024-1-4 17:08
1.下次传图片就直接传那些可以直接显示的，不能直接显示的很少有人会为你下载下来看
2.做一条average的lin ...

好的我下次注意

谢谢

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-5 10:57:52

体系越小，波动倾向于越大，很正常的事情

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