请教gmx_MMPBSA出现“could not convert string to float: 'to'”的解决办法

uenh1998 · 发表于 Post on 2024-1-4 23:19:28

如题题目所描述的那样，在运行gmx_MMPBSA时，出现了“ValueError: could not convert string to float: 'to'”的错误（如图所示）

，看样子是源程序代码的字符串转化为浮点数部分出现了问题，但是使用官网例子却能完美运行完毕，在官网上寻找相应问题有类似的描述，是没有去PBC及删除旋转、平移，但是这些步骤在之前均完成。因此在这里请教一下大家有没有遇到类似的问题，大家是怎么解决的呢。十分感谢大家！

pal · 发表于 Post on 2024-1-5 10:16:49

虽然没用过，但是这种报错直接检查例子的文件和现在的文件有什么差异比较直接吧

uenh1998 · 发表于 Post on 2024-1-5 10:54:17

pal 发表于 2024-1-5 10:16
虽然没用过，但是这种报错直接检查例子的文件和现在的文件有什么差异比较直接吧

该引用的文件都加上了，编码除了打开就乱码的xtc文件也是一样的，实在想不出哪里有差异。不过还是谢谢你的建议

pal · 发表于 Post on 2024-1-5 11:20:36

uenh1998 发表于 2024-1-5 10:54
该引用的文件都加上了，编码除了打开就乱码的xtc文件也是一样的，实在想不出哪里有差异。不过还是谢谢你 ...

能想到的就是原子数是不是超过1w了

uenh1998 · 发表于 Post on 2024-1-5 15:47:30

pal 发表于 2024-1-5 11:20
能想到的就是原子数是不是超过1w了

也不是这个问题，我的体系只有600+原子，甚至比官网例子还要少，且官网结构原子数达到18000个>1万

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[综合交流] 请教gmx_MMPBSA出现“could not convert string to float: 'to'”的解决办法