Lammps输出的xyz文件VMD打不开

s541040349 · 发表于 Post on 2022-10-25 22:42:48

各位老师 lammps输出的xyz格式文件VMD打不开并报错，求解。
Ovito是可以打开的。。。当输出为trj文件才VMD才可以打开

ZZU_SCU · 发表于 Post on 2022-10-26 10:04:31

请贴出你的关于dump.xyz的命令，你看一下这个呢 http://bbs.keinsci.com/thread-29714-1-1.html

s541040349 · 发表于 Post on 2022-11-4 21:50:09

ZZU_SCU 发表于 2022-10-26 10:04
请贴出你的关于dump.xyz的命令，你看一下这个呢 http://bbs.keinsci.com/thread-29714-1-1.html

谢谢老师我尝试一下

Vergelius · 发表于 Post on 2024-1-25 14:01:52

s541040349 发表于 2022-11-4 21:50
谢谢老师我尝试一下

请问您解决这个问题了吗？我试过了加上dump_modify还是不行

abonentendeur · 发表于 Post on 2024-7-25 20:14:49

Vergelius 发表于 2024-1-25 14:01
请问您解决这个问题了吗？我试过了加上dump_modify还是不行

官网上面说VMD使用的格式为atom, custom, dcd, xtc, xyz, yaml，但要把元素以ID顺序写出来，dump_modify sort id element * * *
https://docs.lammps.org/dump.html

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[VMD] Lammps输出的xyz文件VMD打不开