求助：如何使用Gaussian计算混合溶剂(内置+自定义溶剂)的溶解自由能

小congcong · 发表于 Post on 2024-3-4 22:09:43

各位社友大家好，我想用gaussian算葡萄糖分子在水和GVL混合溶剂中的溶剂化自由能采用SMD隐式溶剂模型 GVL不是内置溶剂需要自定义像这种情况下应该怎么去计算呢？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-3-4 22:14:01

按http://sobereva.com/327的1.5.2和1.5.3节的方法计算
如果GVL的介电常数查不到，可以用DFT计算分子的极化率，用MD计算或从实验得知其液态的密度，再用Clausius-Mossotti方程计算介电常数

小congcong · 发表于 Post on 2024-3-4 22:27:34

wzkchem5 发表于 2024-3-4 22:14
按http://sobereva.com/327的1.5.2和1.5.3节的方法计算
如果GVL的介电常数查不到，可以用DFT计算分子的极 ...

老师您好 GVL的介电常数我查到了 Sob老师的这个帖子我看过了其中提到：对于混合溶剂，应该将几种溶剂的溶剂参数按照体积比例进行混合来定义自定义溶剂。以我的体系为例这句话的意思是将GVL和水混合后的溶剂作为一种新溶剂去自定义介电常数吗？至于GVL和水的混合混合溶剂的介电常数则通过您说的实验方法测得液态密度后通过方程计算得到。不知道我的理解是否正确？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-3-5 00:54:08

小congcong 发表于 2024-3-4 15:27
老师您好 GVL的介电常数我查到了 Sob老师的这个帖子我看过了其中提到：对于混合溶剂，应该将几种溶剂的 ...

对，混合溶剂的介电常数等于各个溶剂的介电常数按体积的加权平均
如果实验是量取一定体积的水和一定体积的GVL，混合而成的，那么你已经知道体积比了，不需要知道GVL的密度；只有在实验是通过称重的方式配的混合溶剂的时候，才需要知道GVL的密度，但是一般一种溶剂如果介电常数能查到，那密度很可能也能查到

小congcong · 发表于 Post on 2024-3-5 10:10:48

wzkchem5 发表于 2024-3-5 00:54
对，混合溶剂的介电常数等于各个溶剂的介电常数按体积的加权平均
如果实验是量取一定体积的水和一定体积 ...

明白了非常感谢老师！

杉杉JY · 发表于 Post on 2024-4-4 17:16:39

wzkchem5 发表于 2024-3-5 00:54
对，混合溶剂的介电常数等于各个溶剂的介电常数按体积的加权平均
如果实验是量取一定体积的水和一定体积 ...

请问输入gjf文件的时候，混合溶剂是在关键词那里写solvent=generic，然后直接在末尾写混合溶剂的介电常数=xx吗（其他关键词省略）？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-4-4 18:07:33

杉杉JY 发表于 2024-4-4 10:16
请问输入gjf文件的时候，混合溶剂是在关键词那里写solvent=generic，然后直接在末尾写混合溶剂的介电常数 ...

按http://sobereva.com/327的方法写

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