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[新手求助] gaussian如何模拟乙醇溶剂的氢键作用

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我是量化小白,之前用的最多的溶剂模型是pcm,这次遇到一个体系,其乙醇溶剂中的氢键对反应的作用很明显,求教如何使用能模拟其氢键作用的溶剂模型
The end.

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发表于 Post on 2024-4-16 11:28:34 | 只看该作者 Only view this author
pcm、smd这些隐式溶剂模型无法表现氢键。需要引入合适数量的显式乙醇分子,至少先猜测可能的氢键构型然后去opt

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发表于 Post on 2024-4-16 14:52:08 | 只看该作者 Only view this author
这叫显式溶剂模型,把参与反应的乙醇直接画出来,作为反应物之一,并且通常同时结合隐式溶剂模型使用,这称为杂化溶剂模型
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-16 15:02:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-16 14:52
这叫显式溶剂模型,把参与反应的乙醇直接画出来,作为反应物之一,并且通常同时结合隐式溶剂模型使用,这称 ...

好的 感谢老师 还有请问可以参考您的文章http://sobereva.com/406来构建模型吗
The end.

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发表于 Post on 2024-4-17 04:27:11 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-4-16 15:02
好的 感谢老师 还有请问可以参考您的文章http://sobereva.com/406来构建模型吗

那篇文章主要是讲构造一个溶质被溶剂包裹的环境的,溶剂仅仅起到环境作用。但你当前的情况是溶剂参与了反应,得考虑怎么摆显式溶剂能让它参与到反应过程中,所以情况并不十分相同。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-17 11:16:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-17 04:27
那篇文章主要是讲构造一个溶质被溶剂包裹的环境的,溶剂仅仅起到环境作用。但你当前的情况是溶剂参与了反 ...

好的 感谢老师
The end.

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