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[新手求助] 求助 双分子反应的过渡态 虚频振动仅与一个分子有成键趋势

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求助sob老师,我想计算如图所示反应的过渡态,半醌自由基上的Cl以Cl+的形式加到吡啶N上,但是找到的过渡态的虚频振动只与O有成键断键的趋势,IRC产物一端也并未与N成键,不知这个反应的过渡态该如何寻找?


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发表于 Post on 2019-4-2 17:28:27 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以节约论坛空间、加快下载速度。已经把你的违规超标的附件删了,压缩后重新上传
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-2 18:22:38 | 只看该作者 Only view this author
好的,以后一定记得压缩。这是我的输出文件

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发表于 Post on 2019-4-3 05:34:39 | 只看该作者 Only view this author
光从你传的opt=ts的结果来看倒没有必然问题。没看到IRC不好说
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-3 09:37:29 | 只看该作者 Only view this author
附件是irc的输出文件,产物一端几何优化之后N Cl还是没有成键且距离较远。

顺便想问一下老师,irc像这样两边曲线跑到同一侧是什么原因呢?

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发表于 Post on 2019-4-3 10:33:55 | 只看该作者 Only view this author
WMQueen 发表于 2019-4-3 09:37
附件是irc的输出文件,产物一端几何优化之后N Cl还是没有成键且距离较远。

顺便想问一下老师,irc像这样 ...

你先确保能把所有反应物、产物都优化出来,然后再以其为参考考虑过渡态应该是什么样

gv6打开g09的IRC输出文件就会那样异常显示
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发表于 Post on 2024-9-13 14:55:40 | 只看该作者 Only view this author
您好,请教下,双分子反应采用qst2方法寻找过渡态,是把两个反应物分别优化?还是放在一起优化?

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