计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9001|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求助 双分子反应的过渡态 虚频振动仅与一个分子有成键趋势

[复制链接 Copy URL]

39

帖子

0

威望

777

eV
积分
816

Level 4 (黑子)

求助sob老师,我想计算如图所示反应的过渡态,半醌自由基上的Cl以Cl+的形式加到吡啶N上,但是找到的过渡态的虚频振动只与O有成键断键的趋势,IRC产物一端也并未与N成键,不知这个反应的过渡态该如何寻找?


TS2_3.gjf

1.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 9

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2019-4-2 17:28:27 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以节约论坛空间、加快下载速度。已经把你的违规超标的附件删了,压缩后重新上传
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

39

帖子

0

威望

777

eV
积分
816

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-2 18:22:38 | 只看该作者 Only view this author
好的,以后一定记得压缩。这是我的输出文件

TS2_3.zip

1.12 MB, 下载次数 Times of downloads: 7

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2019-4-3 05:34:39 | 只看该作者 Only view this author
光从你传的opt=ts的结果来看倒没有必然问题。没看到IRC不好说
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

39

帖子

0

威望

777

eV
积分
816

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-3 09:37:29 | 只看该作者 Only view this author
附件是irc的输出文件,产物一端几何优化之后N Cl还是没有成键且距离较远。

顺便想问一下老师,irc像这样两边曲线跑到同一侧是什么原因呢?

TS2_3_2.zip

486.84 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2019-4-3 10:33:55 | 只看该作者 Only view this author
WMQueen 发表于 2019-4-3 09:37
附件是irc的输出文件,产物一端几何优化之后N Cl还是没有成键且距离较远。

顺便想问一下老师,irc像这样 ...

你先确保能把所有反应物、产物都优化出来,然后再以其为参考考虑过渡态应该是什么样

gv6打开g09的IRC输出文件就会那样异常显示
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

3

帖子

0

威望

307

eV
积分
310

Level 3 能力者

7#
发表于 Post on 2024-9-13 14:55:40 | 只看该作者 Only view this author
您好,请教下,双分子反应采用qst2方法寻找过渡态,是把两个反应物分别优化?还是放在一起优化?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 22:35 , Processed in 0.308781 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list