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[GROMACS] GROMACS做聚合物模拟,要复现一篇文献一般该怎么做呢

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本人GROMACS小白,导师要复现一篇文献,关于聚合物的分子动力学,一般该怎么做呢

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发表于 Post on 2024-9-4 10:52:58 | 只看该作者 Only view this author
要复现文献就是跟他的method做哦,建议先自己试试看,等遇到具体的问题再问。
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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发表于 Post on 2024-9-4 10:57:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yihanxu 于 2024-9-4 11:00 编辑

楼主用过gromacs吗?做过动力学计算吗?如果都没有的话是没办法复刻的,gromacs的用法需要系统的学习。materials studio用起来简单,适合非要做动力学的动力学模拟小白。
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发表于 Post on 2024-9-4 11:59:20 | 只看该作者 Only view this author
以你当前的基础没人能给你有效的回复。至少先入了门,了解了各种常识知识,问比较具体的问题别人才能帮你
对于GROMACS小白,强烈建议通过北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)完整系统学一遍,可以算是GROMACS驾校
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-4 13:42:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-4 11:59
以你当前的基础没人能给你有效的回复。至少先入了门,了解了各种常识知识,问比较具体的问题别人才能帮你
...

好的,看了一圈,我已经计划报这个班了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-4 13:42:48 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2024-9-4 10:52
要复现文献就是跟他的method做哦,建议先自己试试看,等遇到具体的问题再问。

明白了,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-4 13:44:13 | 只看该作者 Only view this author
yihanxu 发表于 2024-9-4 10:57
楼主用过gromacs吗?做过动力学计算吗?如果都没有的话是没办法复刻的,gromacs的用法需要系统的学习。mate ...

谢谢,之前没用过Gromacs,现在打算报班了

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发表于 Post on 2024-9-5 09:01:01 | 只看该作者 Only view this author
luoxuping 发表于 2024-9-4 13:44
谢谢,之前没用过Gromacs,现在打算报班了

嗯嗯 上完gromacs培训班肯定就会做了 祝顺利!
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