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[综合交流] 求助:锂离子在gaff或者在opls力场下的参数

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锂离子在gaff或者在opls力场下的参数

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发表于 Post on 2024-6-19 10:32:20 | 只看该作者 Only view this author
gaff本身没有锂离子吧,你可以从常见的amber力场里面找一下,通用的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-19 10:46:19 | 只看该作者 Only view this author
低调的板凳 发表于 2024-6-19 10:32
gaff本身没有锂离子吧,你可以从常见的amber力场里面找一下,通用的

好的,谢谢

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发表于 Post on 2024-6-19 11:53:29 | 只看该作者 Only view this author
KBFF、Merz的离子参数也都兼容GAFF
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2024-6-19 13:59:44 | 只看该作者 Only view this author
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.langmuir.3c01432

文献里面有现成的哦,兼容GAFF

; Merz JCIM 2021 Monovalent HFE fit for OPC3 ; DOI: 10.1021/acs.jcim.0c01390
Li           3       6.94    0.0000  A   2.2628827441e-01   1.3625196000e-02
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-19 15:00:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-19 11:53
KBFF、Merz的离子参数也都兼容GAFF

老师,体系里其他分子用了opls力场,可以同时使用吗

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发表于 Post on 2024-6-20 00:31:50 | 只看该作者 Only view this author
打豆豆的灰鸭 发表于 2024-6-19 15:00
老师,体系里其他分子用了opls力场,可以同时使用吗

GAFF和OPLS-AA不兼容
能用OPLS-AA描述的体系都能用sobtop基于GAFF/GAFF2力场创建拓扑文件来描述,没什么理由非得刻意用原子类型名非常混乱的OPLS-AA
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-20 15:35:41 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2024-6-19 13:59
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.langmuir.3c01432

文献里面有现成的哦,兼容GAFF

想问一下,这个参数单位是什么,是nm 和KJ/mol吗

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