[已解决]模拟固体粘土和甲烷气体的混合体系时，如何保证体系为电中性才是合理的

牧生 · 发表于 Post on 2024-2-7 11:19:15

本帖最后由牧生于 2024-3-9 10:53 编辑

近日模拟粘土和水接触，使用了clayff力场描述了蒙脱石，由于蒙脱石本身带有负电了，我就加入了水和钠离子，模拟很顺利，看起来也很合理。

但如果我模拟蒙脱石+甲烷气体（gaff力场），那么，由于蒙脱石带有负电，那么这里也应该加入钠离子，但是为了保持电中性而在气体中强行加钠离子就显得不太说的通。

clayff力场的文件里有钠离子的，是我粗心了

Seyilaxa · 发表于 Post on 2024-2-7 13:41:27

蒙脱石中本身也有用于中和负电荷的阳离子，应该参考晶体的实际晶胞搭建

slxc920113 · 发表于 Post on 2024-2-8 23:20:26

蒙脱石本身存在质子或者Li+，Na+，K+等抗衡离子

znjnancy · 发表于 Post on 2024-7-25 20:15:32

你好，请问固体粘土的结构文件可以分享给我吗

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[GROMACS] [已解决]模拟固体粘土和甲烷气体的混合体系时，如何保证体系为电中性才是合理的