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[综合交流] 多肽和大分子蛋白相互作用适合从量化的角度分析吗?

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楼主
我做的方向是多肽和大分子蛋白相互作用,前期用Alphafold Server做了多肽和大分子蛋白的分子对接,
也用Amber跑了MD,现在想从量化的角度去分析一下,
这样的想法可行吗,求大佬解答

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发表于 Post on 2024-8-30 01:27:29 | 只看该作者 Only view this author
主要看你想考察的问题和方向,分析局部之间的若相互作用是可以的,此外,你的字体好有意思,上次看到如此多的突出显示还是sob老师的博文
不羡大神不羡仙,努力学习每一天

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发表于 Post on 2024-8-30 07:55:01 | 只看该作者 Only view this author
别弄那么大的高亮的红字,99.999%的人视力没问题
不要用《多肽和大分子蛋白相互作用》作为标题,正确使用书名号,否则会造成误导。这次给你改了,以后注意

用簇模型做量化计算,并结合Multiwfn做波函数分析,完全可以而且很常见。参看下文
要善用簇模型,不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问题
http://sobereva.com/597
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表!
http://sobereva.com/667http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html

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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-30 08:28:29 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师吗,感谢各位大佬批评指正

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