计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 112|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[其它程序] 求助按照charmmGUI给的readme文件进行produnction时候模拟过程不连续

[复制链接 Copy URL]

3

帖子

0

威望

91

eV
积分
94

Level 2 能力者

在charmmGUI上使用[size=14.592px]Bilayer Builder构建了POPC膜-跨膜蛋白-小分子配体复合体系,构建过程中没有什么特别的设置,以gromcacs软件格式输出,然后在超算平台直接上传gromacs文件夹,使用readme文件中的代码尝试跑了3个production循环,用gmx trjcat命令连接起这step7_1.xtc step7_2.xtc step7_3.xtc时候时提示warning:[size=14.592px]same Start time as previous,这是怎么回事呢?cpt文件衔接有问题吗? gmx_GUI.slurm (1.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

屏幕截图 2024-09-03 175842.png (49.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

屏幕截图 2024-09-03 175842.png

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 15:01 , Processed in 0.188457 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list