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[建模与可视化] 如何绘制分子旋转gif图

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请问老师怎么绘制使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com)这个帖子中的分子旋转图呀?想放在PPT上展示

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发表于 Post on 2024-9-12 17:26:29 | 只看该作者 Only view this author
ChimeraX
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-9-12 20:45:45 | 只看该作者 Only view this author
VMD 的插件 movie maker 也能做

我之前画过一对手性分子绕对称轴旋转的动画,是手动生成结构后拼成的 gif,Windows 上的 gif 软件是 ScreenToGif
十八介姑娘一蕾花呀,白白介牙齿、红红介嘴唇,得人惜

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发表于 Post on 2024-9-13 09:05:44 | 只看该作者 Only view this author
Chem3D,开着录屏,扒拉一下分子就转起来了

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发表于 Post on 2024-9-13 09:31:54 | 只看该作者 Only view this author

最简单办法使用截图软件 PixPin 直接录制 GIF,适合任务量不大的情况

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-13 10:33:12 | 只看该作者 Only view this author
wxyhgk 发表于 2024-9-13 09:31
最简单办法使用截图软件 PixPin 直接录制 GIF,适合任务量不大的情况

请问你这让分子旋转起来是咋操作的呀

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发表于 Post on 2024-9-13 16:43:11 | 只看该作者 Only view this author
xiewei 发表于 2024-9-13 10:33
请问你这让分子旋转起来是咋操作的呀

我用的 Avogadro 这个软件,在窗口用鼠标右键划一下,就能让分子旋转,然后用 PixPin 直接录制 GIF

这种做法只适合临时搞一下,如果要指定额定的坐标轴,定量的特定的方向,就不能这么做了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-13 16:45:59 | 只看该作者 Only view this author

请问老师这个软件怎么让分子旋转起来呀

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发表于 Post on 2024-9-13 17:23:56 | 只看该作者 Only view this author
xiewei 发表于 2024-9-13 16:45
请问老师这个软件怎么让分子旋转起来呀

顶端有个spin movie按钮,一点就得到了旋转动画文件,这比任何其它程序都要简单得多得多得多,一键完成。只不过得到gif的话需要再转格式
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-14 09:51:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-13 17:23
顶端有个spin movie按钮,一点就得到了旋转动画文件,这比任何其它程序都要简单得多得多得多,一键完成。 ...

感谢老师

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