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[其它程序] 求助packmol搭建模型后用DFTB跑动力学模拟一直报错

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楼主
packmol搭建碳氢原子的模型后用DFTB跑动力学模拟一直报如下错误,不断改变各种设置,调整原子之间的数目,距离,温度,盒子大小,仍然报错。请问各位老师,有什么办法解决吗?

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傻傻的木瓜

2#
发表于 Post on 2024-10-9 19:20:44 | 只看该作者 Only view this author
别一上来就把问题推给packmol,除非是有别的软件构建初始结构运行成功的例子;研究目的和计算方法(包括软件及参数等)明明更加重要,请看社长博文http://sobereva.com/620补充清楚。
……
等等,这个碳原子和氢原子随机堆出来的结构,以及楼主希望通过计算获得的变化过程,真的具备化学意义吗?
√546=23.36664289109

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