[已解决]求助，gromacs出现"No enough memory"问题

Tanghaoru · 发表于 Post on 2024-1-28 19:42:45

本帖最后由 Tanghaoru 于 2024-1-29 16:52 编辑

在显卡为3050的笔记本上用的是2020.6_GPU版本的gromacs进行模拟。MD计算就显示“No enough memory”。能正常进行能量最小化、NVT、NPT计算。请问如何解决。下面是我电脑的配置，想知道是不是电脑带不动。我在超算上能正常提交计算。

junyang · 发表于 Post on 2024-1-28 23:19:30

内存不够，买内存条

junyang · 发表于 Post on 2024-1-28 23:20:50

打开资源管理器，运行程序，如果内存爆了，就是内存不够

Tanghaoru · 发表于 Post on 2024-1-28 23:29:55

junyang 发表于 2024-1-28 23:20
打开资源管理器，运行程序，如果内存爆了，就是内存不够

好的谢谢。刚检查了，应该是内存不够。内存峰值达到97%，gromacs就自动停了，然后报错。

Tanghaoru · 发表于 Post on 2024-1-29 16:50:36

已排查解决，是忘记设置Gromacs调用3050的GPU。

Graphite · 发表于 Post on 2024-1-29 17:34:18

本帖最后由 Graphite 于 2024-1-29 17:35 编辑

不可能是配置问题，因为提示中提到要分配1.844 E+19个元素，这个数是64位正整数的最大值，很显然是个数据溢出的bug。
要满足10^19级的内存的需求，也太科幻了

niumx · 发表于 Post on 2024-10-30 09:21:34

Tanghaoru 发表于 2024-1-29 16:50
已排查解决，是忘记设置Gromacs调用3050的GPU。

你好，可以分享下是使用什么命令调用gpu的吗？

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[GROMACS] [已解决]求助，gromacs出现"No enough memory"问题

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