计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2678|回复 Reply: 27
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 电化学反应中单电子转移反应的能垒如何计算?

[复制链接 Copy URL]

160

帖子

0

威望

1619

eV
积分
1779

Level 5 (御坂)

在电化学溶液反应中单电子转移反应的能垒,是不是通过G=nFE,计算出整个反应的自由能,然后通过得到阳极反应的标准电极电势,通过Ecell=E(+)-E(-),得到阴极的电极电势再反推出自由能?
独立之精神 自由之思想

977

帖子

0

威望

1929

eV
积分
2906

Level 5 (御坂)

偽語言學家+註冊摸魚師

2#
发表于 Post on 2023-3-6 16:29:57 | 只看该作者 Only view this author
看你已知什么算什么。另外delta(G) = - nFE。
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18171

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2023-3-6 16:34:31 | 只看该作者 Only view this author
这只能得到自由能变,不能得到能垒。要算能垒的话,单纯的单电子转移反应用Marcus理论算,伴随键的断裂和形成的单电子转移反应用过渡态理论算
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

487

帖子

1

威望

4042

eV
积分
4549

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2023-3-6 17:08:29 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-6 16:34
这只能得到自由能变,不能得到能垒。要算能垒的话,单纯的单电子转移反应用Marcus理论算,伴随键的断裂和形 ...

"伴随键的断裂和形成的单电子转移反应用过渡态理论算",我想问一下,这时候过渡态的电荷数是如何确定呢?是失电子前的还是失电子后的?谢谢!
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18171

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2023-3-6 18:20:37 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2023-3-6 10:08
"伴随键的断裂和形成的单电子转移反应用过渡态理论算",我想问一下,这时候过渡态的电荷数是如何确定呢? ...

如果电子转移和键的形成/断裂是协同的话,估计只能把电极也显式考虑进来,把电极和溶质当作一整个体系来算。这样就不存在需要为溶质指定整数电荷的问题了。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

160

帖子

0

威望

1619

eV
积分
1779

Level 5 (御坂)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-6 21:47:19 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2023-3-6 16:29
看你已知什么算什么。另外delta(G) = - nFE。

谢谢老师
独立之精神 自由之思想

160

帖子

0

威望

1619

eV
积分
1779

Level 5 (御坂)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-6 22:02:04 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-6 16:34
这只能得到自由能变,不能得到能垒。要算能垒的话,单纯的单电子转移反应用Marcus理论算,伴随键的断裂和形 ...

老师,用sob老师博文里面的四点法去算重组能的时候,如果中性基态的反应物,发生单电子转移反应,电荷和spin都发生了变化,参照以下计算步骤:
(a) 优化中性状态结构
(b) 在(a)的结构下算中性状态的能量E1。
(c) 在(a)的结构下算阳离子状态的能量E2。
(d) 优化阳离子状态结构
(e) 在(d)的结构下算中性状态的能量E3。
(f) 在(d)的结构下算阳离子状态的能量E4。
问题:
1. 能垒约等于|E3-E1|+|E2-E4|的能量吗?
2. 能量是指单点能下的电子能量吗?


独立之精神 自由之思想

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18171

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2023-3-7 00:43:47 | 只看该作者 Only view this author
yjb 发表于 2023-3-6 15:02
老师,用sob老师博文里面的四点法去算重组能的时候,如果中性基态的反应物,发生单电子转移反应,电荷和s ...

那样算出来的是重组能,重组能是用来套Marcus公式算能垒的,其本身不是能垒。而且注意,只有自交换反应才是按|E3-E1|+|E2-E4|的方法算重组能,如果是比如说A- + B -> A + B-,且A和B不是一个分子,那么要按IUPAC定义算重组能(https://goldbook.iupac.org/terms/view/R05292
对,能量需要用电子能
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

160

帖子

0

威望

1619

eV
积分
1779

Level 5 (御坂)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-7 12:12:28 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-7 00:43
那样算出来的是重组能,重组能是用来套Marcus公式算能垒的,其本身不是能垒。而且注意,只有自交换反应才 ...

老师,“如果是比如说A- + B -> A + B-,且A和B不是一个分子,”,是不是分别需要用四点法算A和B的重组能,把它们的重组能加和之后,通过Marcus公式,和算出来的整个电化学反应的自由能变化,推导出活化能。
独立之精神 自由之思想

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18171

Level 6 (一方通行)

10#
发表于 Post on 2023-3-7 17:42:48 | 只看该作者 Only view this author
yjb 发表于 2023-3-7 05:12
老师,“如果是比如说A- + B -> A + B-,且A和B不是一个分子,”,是不是分别需要用四点法算A和B的重组能 ...

这是sob老师的博文很容易让人误解的一个地方,我也掉过这个坑,还跟sob老师讨论过。
关键问题在于,“(一个分子)A的重组能”是什么意思?
假设考虑的是A-变成A的过程。那么“A的重组能”可以有两种定义:(1)反应A- + A -> A + A-的重组能;(2)A对反应A- + B -> A + B-的重组能的贡献。
sob老师说的四点法重组能指的是(1);另外有些人说重组能等于A对重组能的贡献和B对重组能的贡献的加和,这些人所说的”A对重组能的贡献“指的是(2),计算方法是A-结构下A的能量减去A结构下A的能量。但是很多人会先按(1)的定义来算A的重组能,再把同一个数字套到(2)的定义来算A- + B -> A + B-的重组能,这样算是错的。我不知道定义(1)和定义(2)是不是有一个是错的,还是说两者都对,但是同一个计算混用两个定义肯定是错的。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
yjb + 5 谢谢

查看全部评分 View all ratings

BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

70

帖子

0

威望

1691

eV
积分
1761

Level 5 (御坂)

11#
发表于 Post on 2023-3-25 21:14:36 | 只看该作者 Only view this author
有些不明白了,请问老师,要是算反应A- + B -> A + B-的重组能,是否是以下方法计算的:
对于A-:(a) 优化A-结构
(b) 在(a)的结构下算能量E1。
(c) 在(a)的结构下算A的能量E2。
(d) 优化A状态结构
(e) 在(d)的结构下算A-的能量E3。
(f) 在(d)的结构下算A的能量E4。
对于B:(a) 优化B结构
(b) 在(a)的结构下算能量E1。
(c) 在(a)的结构下算B-的能量E2。
(d) 优化B-状态结构
(e) 在(d)的结构下算B的能量E3。
(f) 在(d)的结构下算B-的能量E4。
然后两次重组能相加除以2.
是这样理解的吗?,谢谢老师

160

帖子

0

威望

1619

eV
积分
1779

Level 5 (御坂)

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-29 12:54:05 | 只看该作者 Only view this author
量化新人 发表于 2023-3-25 21:14
有些不明白了,请问老师,要是算反应A- + B -> A + B-的重组能,是否是以下方法计算的:
对于A-:(a) 优化 ...

我的理解只需要做A的重组能。
独立之精神 自由之思想

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18171

Level 6 (一方通行)

13#
发表于 Post on 2023-3-29 16:50:37 | 只看该作者 Only view this author
yjb 发表于 2023-3-29 05:54
我的理解只需要做A的重组能。

不是的。看8楼IUPAC对重组能定义的链接,自然就知道该怎么算了,一共涉及到4个能量的加减,其中2个是A的,2个是B的。而不是8个能量,更不是只需要算A那边(不然把A和B调换一下,重组能岂不是就变了?重组能总不能和反应方程式书写的顺序有关)
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

70

帖子

0

威望

1691

eV
积分
1761

Level 5 (御坂)

14#
发表于 Post on 2023-3-29 22:02:54 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-29 16:50
不是的。看8楼IUPAC对重组能定义的链接,自然就知道该怎么算了,一共涉及到4个能量的加减,其中2个是A的 ...

嗯嗯。明白了,谢谢老师

64

帖子

0

威望

716

eV
积分
780

Level 4 (黑子)

15#
发表于 Post on 2024-6-13 13:21:36 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-7 00:43
那样算出来的是重组能,重组能是用来套Marcus公式算能垒的,其本身不是能垒。而且注意,只有自交换反应才 ...

请问老师,如果反应是 A- -> A + e- 该如何计算呢?

学生看到两篇论文的方法如图:
文献1:Environ. Sci. Technol. 2020, 54, 12673−12683
文献2:Environ. Sci. Technol. 2019, 53, 24, 14528–14537

还想请教老师,文献1计算的是吉布斯自由能,文献二则是反应的焓变。如果想比较电化学中发生直接电子转移(单电子转移)的难易,应该计算自由能还是焓呢?谢谢老师

202406131314305566..png (146.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 21)

文献2

文献2

202406131314095454..png (89.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

文献1

文献1

202406131314011654..png (100.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

文献1

文献1

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 04:38 , Processed in 0.207144 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list