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[新手求助] SN2反应过渡态找不到

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本帖最后由 lurensan 于 2023-11-19 01:38 编辑

各位老师好,我用m062x/def2svp 在气态下寻找一个取代反应的过渡态,直接摆结构老是跑成原料。使用限制性优化可以找到过渡态初猜,但是放开限制还是找不到过渡态,对键长进行柔性扫描发现是能量一直升高,没有最大值,请问各位老师接下来该怎样找过渡态呢?按理说这个取代反应过渡态应该存在,如果不存在,下一步过渡态应该是怎样的呢?希望老师支支招 desktop.7z (821.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)



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发表于 Post on 2023-11-19 02:53:01 | 只看该作者 Only view this author
实验是在溶液里做的吧?如果是,应该在溶液里找过渡态。
溶液里存在的过渡态,气态下未必存在
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-11-20 15:54:31 | 只看该作者 Only view this author
柔性扫描一根硫氧键是想要做什么呢?
硫作为第三周期元素,其成四根键的趋向没有第二周期元素那样大,加成-离去的机理与SN2的机理都是有可能走得通的。可以考虑一下是否有走别的途径反应的可能性。

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发表于 Post on 2023-11-20 17:00:32 | 只看该作者 Only view this author
感觉你这个氟用的就不太合理。硫氟键这个氟应该不太容易离去吧,试试加溶剂模型,甚至显示溶剂模型也许有效,气相下这个过程应该挺难发生的吧。另外一个建议,可以给带负电的部分加点弥散试试,少数情况下会有帮助。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-21 13:39:51 | 只看该作者 Only view this author
啊不错的飞过海 发表于 2023-11-20 15:54
柔性扫描一根硫氧键是想要做什么呢?
硫作为第三周期元素,其成四根键的趋向没有第二周期元素那样大,加成 ...

是的,加成离去和SN2的机理在之前的计算中都有发现。之前通过扫描O-S键键长可以给出一个较好的初猜,但是这个一直找不到。

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