本帖最后由 Hugo_314cat 于 2025-2-8 10:40 编辑
ChemCrackX是个人在2024年2月份开始的一个综合性计算化学辅助工具包,旨在用尽量少的人力去做尽量多的活儿。目前CCX还在不断地开发和调试当中。
第一篇 浅试一下用ChemCrackX对小体系生成CI点结构瞎猜
case1: 环丁二烯->金字塔烷:分别对环丁二烯和金字塔烷做结构生成后进行CI结构初猜
case2: 苯->盆苯: 分别对苯和盆苯做结构生成后进行CI结构初猜
case3: 丙烯->丙烯 (1,3-氢迁移): 分别对迁移前和迁移后的丙烯做结构生成后进行CI结构初猜
case4: Z-己三烯的顺式环化: 分别对Z-己三烯和环己二烯做结构生成后进行CI结构初猜
我个人不是做CI的,也不知道结果的好坏,属于是纯乐子。不过看结构还挺好看的。
第二篇 用ChemCrackX快速进行构象分析
ChemCrackX是非常适合对有机分子进行构象分析的,一般在几十秒内就能给出相当令人满意的结果,而且可以直接在ChemDraw画好后复制SMILES作为输入,非常的方便。下面给出一些例子:
己烷, 1.012s
顺式十氢化萘, 1.924s
一个具有A(1,3)相互作用的分子, 1.556s
反式5并7环系, 1.923s
顺式5并7环系,2.162s
ChemCrackX不仅可以进行构象搜索,还能联用其内置的指令一站式将这些分子导出成任意格式,从而省去很多不必要的操作。
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