关于gromacs跑动力学任务中断，出现CuDA error #719的问题

Soulmate

大家好，想请教大家一个问题：
  鄙人在跑蛋白-配体复合物100ns时长动力学的时候，每次任务都是中途停止，有时是40%停止，有时是90%停止，所以每次续跑很麻烦。

报错提示如下：
   Assertion failed:
   Condition:stat == cudasuccess
   Freeing of the device buffer failed. CuDA error #719 (cudaErrorLaunchFailure):
   unspecified launch failure.


  上网查了一下，有人说是GPU占用满了的问题，有人说是程序版本不兼容，也有人说是cuda版本的原因。
  所以想向论坛的大佬们请教一下，什么原因的可能性最大。


鄙人电脑配置如下:
   显卡：RTX 4070Ti super 16GB;   CPU:intel i7-14700KF   内存：32GB
   Gromacs version: 2024.04     显卡驱动版本：550.120   Cuda 版本：12.4    python version: 3.10.12
   模拟体系：加上水分子在内，大概30000个原子大小
所有操作都是在Ubuntu22.04环境下进行,且未同时运行其它任何大型程序。
   谢谢大家
  

FrancisCho

同问，我遇到的是#700报错，一般是在跑第一步时就报错，所以我猜测我遇到的问题应该是体系结构有问题

Seyilaxa

可以先试试更新显卡驱动和CUDA版本，还有问题的话再换个gromacs跑跑看

Huschein

GMX2024的几个版本似乎CUDA都有点问题，可以换版本试试

Soulmate

Seyilaxa 发表于 2025-1-22 12:20
可以先试试更新显卡驱动和CUDA版本，还有问题的话再换个gromacs跑跑看

好的，谢谢你，我试试

Soulmate

Huschein 发表于 2025-1-22 21:38
GMX2024的几个版本似乎CUDA都有点问题，可以换版本试试

好的，那我换成2023版，谢谢你的建议

Soulmate

FrancisCho 发表于 2025-1-22 07:58
同问，我遇到的是#700报错，一般是在跑第一步时就报错，所以我猜测我遇到的问题应该是体系结构有问题

这个我也不太清楚，而且咱俩的报错代码不一样，期待有大佬解答

喵星大佬

Intel的14代问题

Soulmate

喵星大佬 发表于 2025-1-26 01:33
Intel的14代问题

请问大佬为什么会是英特尔14代处理器的问题呢，小弟想多了解点，请大佬赐教

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FrancisCho 发表于 2025-1-22 07:58
同问，我遇到的是#700报错，一般是在跑第一步时就报错，所以我猜测我遇到的问题应该是体系结构有问题

我之前遇到过类似问题，确实是体系或者mdp文件设置的问题，猜测因该是有分子重叠导致的能量爆炸，内存溢出。重新建模和修改参数后问题消失

tptp

遇到过，的确有可能是体系的问题，不要以为这个就纯粹是硬件问题。可以先检查检查体系，看看模拟中断时输出的PDB文件结构。