集群上使用slurm调度系统提交作业进行g16计算时遇到了报错

生煎小馒头 · 发表于 Post on 2025-4-3 20:56:44

各位老师好，最近刚刚入门量子化学高斯计算。想向各位老师请教一些问题，我使用的版本是g16，集群系统是centos7.9，服务器单节点可用内存是173G，我在使用集群上使用slurm调度系统提交作业进行g16计算时遇到了以下报错:[td]Problem with file /data/home/jiangzij/g16/l1.exe omode 33261 compare 7.

/var/spool/slurm/d/job85234/slurm_script: line 12: 255406 Segmentation fault (core dumped)g16 1.gjf[/td]不知该如何解决
1.gjf为输入文件，g16.sh为提交作业的脚本文件，85234.err和85234.out分别为错误日志和输出日志，Gau-185007.inp为计算过程中生成的临时文件
附上百度网盘链接[td]通过网盘分享的文件：g-16.zip

链接: https://pan.baidu.com/s/1RpkcjZ0SlA8_4nM15PFU0Q?pwd=ggaq 提取码: ggaq

--来自百度网盘超级会员v3的分享[/td]

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2025-4-3 21:10:38

这帖是怎么打字排版的，除了深绿背景外还整出了分栏效果……

才4 kB尺寸的zip压缩包大可不必动用网盘，直接作为帖子附件上传就行了。

2877321934 · 发表于 Post on 2025-4-3 21:39:36

http://sobereva.com/439

遇到报错问题时，可以将log文件中的关键报错部分google一下，至少80%都能解决。

生煎小馒头 · 发表于 Post on 2025-4-3 21:44:28

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-4-3 21:10
这帖是怎么打字排版的，除了深绿背景外还整出了分栏效果……

才4 kB尺寸的zip压缩包大可不必动用网盘， ...

我试了好几次都是这个排版我还纳闷呢，以为更新了呢

生煎小馒头 · 发表于 Post on 2025-4-3 21:45:00

2877321934 发表于 2025-4-3 21:39
遇到报错问题时，可以将log文件中的关键报错部分google一下，至少80%都能解决。

谢谢老师，我尝试1下

生煎小馒头 · 发表于 Post on 2025-4-3 22:06:43

生煎小馒头发表于 2025-4-3 21:45
谢谢老师，我尝试1下

您好老师，我试了您说的方法可以运行了，但是一直是单核一个线程在跑，是我设置有问题吗

2877321934 · 发表于 Post on 2025-4-3 22:17:56

生煎小馒头发表于 2025-4-3 22:06
您好老师，我试了您说的方法可以运行了，但是一直是单核一个线程在跑，是我设置有问题吗

你的gjf文件里没设置线程数和内存，就默认是单线程跑了

生煎小馒头 · 发表于 Post on 2025-4-3 22:22:00

2877321934 发表于 2025-4-3 22:17
你的gjf文件里没设置线程数和内存，就默认是单线程跑了

哦哦，明白了谢谢老师，我去设置一下

sobereva · 发表于 Post on 2025-4-3 22:57:18

仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html，不要用“gaussian16计算遇到问题”这种没有区分度的标题。这次给你改了，以后注意

发完帖子好好检查帖子，有问题及时修改。不要把其它地方的文本框直接往帖子编辑的窗口里粘贴。用纯文本方式粘贴就没这恶心事

sobereva · 发表于 Post on 2025-4-3 22:58:27

生煎小馒头发表于 2025-4-3 22:06
您好老师，我试了您说的方法可以运行了，但是一直是单核一个线程在跑，是我设置有问题吗

认真把此文看了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

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