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[综合交流] polymer的polaron和bipolaron的LUMO-HOMO gap哪个更大

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本帖最后由 水庐小亚 于 2025-6-20 04:10 编辑

各位老师,我尝试用Gaussian 计算某个polymer在neutral, polaron和bipolaron状态下的UV-Vis。我已经针对每个状态进行了Opt+freq(UM062X/6-31g*,scrf=DMSO),并已计算能量(UM062X/6-311g**,scrf=DMSO),最后用TD-DFT预测UV-Vis。计算结果表明,polaron的UV-Vis中excited state 1在2825nm,对应主要激发态为303a--->304a的单电子激发,能量差为1.7eV(图片1)。bipolaron的UV-Vis的UV-Vis中excited state 1在1587nm,对应主要激发态为304a--->305a的单电子激发,能量差为2.1eV(图片2)。
请问为什么polaron的excited state 1 主要激发态的gap比bipolaron的gap更小,是计算错误还是确实如此,如果真实情况如此,是否有理论可以支撑?

202506200403497191..png (334.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

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202506200403277264..png (322.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

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发表于 Post on 2025-6-20 19:12:10 | 只看该作者 Only view this author
U-TDDFT有自旋污染,结果不靠谱,建议改用X-TDDFT(https://mp.weixin.qq.com/s?__biz ... ionid=1750417916#rd
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-21 23:15:49 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-6-20 19:12
U-TDDFT有自旋污染,结果不靠谱,建议改用X-TDDFT(https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU5NjMxNjkzMw==&mi ...

想尝试一下X-TDDFT计算,王老师是否能提供BDF免费试用安装包

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发表于 Post on 2025-6-22 07:33:43 | 只看该作者 Only view this author
水庐小亚 发表于 2025-6-21 23:15
想尝试一下X-TDDFT计算,王老师是否能提供BDF免费试用安装包

也可以用免费的ORCA的DFT/ROCIS,可以得到自旋纯态的激发态

当前明显文不对题,标题里的HOMO-LUMO gap和光学gap完全是两码事,看下文
正确地认识分子的能隙(gap)、HOMO和LUMO
http://sobereva.com/543http://bbs.keinsci.com/thread-16758-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-6-22 08:21:14 | 只看该作者 Only view this author
水庐小亚 发表于 2025-6-21 23:15
想尝试一下X-TDDFT计算,王老师是否能提供BDF免费试用安装包

https://bdf-manual.readthedocs.io/zh-cn/latest/Introduction.html
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-23 05:59:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-6-22 07:33
也可以用免费的ORCA的DFT/ROCIS,可以得到自旋纯态的激发态

当前明显文不对题,标题里的HOMO-LUMO gap ...

谢谢sob老师指导,我尝试一下orca的DFT/ROCIS

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-2 09:02:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-6-22 07:33
也可以用免费的ORCA的DFT/ROCIS,可以得到自旋纯态的激发态

当前明显文不对题,标题里的HOMO-LUMO gap ...

我用orca尝试计算了Bipolaron的ROCIS,我预留了800G的磁盘空间,即使只设置了NRoots 10和MaxDim 5,最终因为爆满而aborting the run。想请教有什么办法能够完成计算吗,以下是我的输入inp文件。

! UKS B3LYP def2-SVP TightSCF

%pal
  nprocs 8
end

%maxcore 3000


%rocis
  NRoots 10                 
  MaxDim 5
  ETol 1e-6
  RTol 1e-6
  MaxIter 50
  NGuessMat 512
  DoDFTCIS true            
  DFTCIS_c 0.20
  DoDipoleLength        true
  DoDipoleVelocity      true
  DecomposeFoscLength   true
  DecomposeFoscVelocity true
  DoFullSemiclassical   true
end

%output
  PrintLevel 4
end

* xyz  -2   3
C     11.54148800   -0.34734900   -0.45748300
C     10.65463200    0.73985900   -0.42923200
C      9.26920600    0.64181200   -0.48881700
C      8.74752000   -0.68912600   -0.58526100
C      9.62520200   -1.81495200   -0.60320900
C     10.98235500   -1.66014200   -0.54080000
C      8.38351900    1.76333200   -0.44704100
C      7.02818400    1.60970500   -0.51217900
C      6.47019400    0.29672900   -0.62665500
C      7.36106800   -0.78214800   -0.64721000
C      5.14606400   -0.27129200   -0.64755800
C      5.37214300   -1.75682500   -0.70917400
O      6.72380000   -1.99408900   -0.70952300
C     12.85813800    0.19800400   -0.31463000
C     12.66869200    1.65620600   -0.22914400
O     11.30749100    1.92817200   -0.30444400
O     13.45054500    2.57340600   -0.14159300
O      4.59850400   -2.66955700   -0.79213200
C      2.54225000   -0.30364300   -0.49127300
C      1.65578900    0.75674800   -0.62830100
C      0.26152100    0.66724700   -0.49749700
C     -0.23867500   -0.62872000   -0.18702500
C      0.64656500   -1.72982500   -0.02396300
C      2.00163200   -1.58210200   -0.16713300
C     -0.62404100    1.76814200   -0.66054700
C     -1.97910400    1.62027700   -0.51692900
C     -2.51957400    0.34185600   -0.19223900
C     -1.63282900   -0.71832500   -0.05582500
C     -3.85222600   -0.23073300   -0.02545600
C     -3.61465600   -1.67906000    0.22572700
O     -2.25331200   -1.90685000    0.20644400
C      3.87511200    0.26867700   -0.65650000
C      3.63820700    1.71687700   -0.90843000
O      2.27682000    1.94509800   -0.89020200
O      4.39284600    2.62173100   -1.14580300
O     -4.36863400   -2.58442300    0.46321200
C     20.38430100   -0.68067500    0.91759500
C     19.51458600    0.35662600    1.14091100
C     18.14430900    0.32553600    0.83117000
C     17.69172000   -0.89645400    0.24365900
C     18.58417700   -1.97981600    0.00982100
C     19.91393300   -1.87837500    0.34012500
C     17.23864300    1.39398500    1.06853100
C     15.91161600    1.28931600    0.73479400
C     15.42142000    0.09397000    0.13480700
C     16.32498400   -0.94455400   -0.07441400
C     14.12905200   -0.40674400   -0.28616400
C     14.37280800   -1.76899500   -0.75546400
O     15.73802100   -2.04561500   -0.60689000
C     21.73633000   -0.23896800    1.38869600
C     21.45689500    1.17747000    1.89270100
O     20.12846000    1.46009800    1.71525900
O     22.21806700    1.96473900    2.37292500
O     13.65672400   -2.61574000   -1.24094700
H      9.18775400   -2.80548200   -0.67135900
H     11.64030200   -2.51656300   -0.57194600
H      8.81919800    2.75331000   -0.36338800
H      6.37623000    2.46882800   -0.48844000
H      0.22433000   -2.69879000    0.21981400
H      2.65716200   -2.43001000   -0.04552300
H     -0.20210200    2.73714200   -0.90470700
H     -2.63475100    2.46808000   -0.63868300
H     18.18479900   -2.88439700   -0.43638500
H     20.59469700   -2.70519500    0.16072100
H     17.61951800    2.30342200    1.52135200
H     15.23514100    2.11430800    0.90669300
H     22.50010000   -0.19139400    0.60476700
H     22.14942600   -0.83246800    2.21164800
C    -20.43654700    0.59179600    0.62536400
C    -19.57923100   -0.46701000    0.78689000
C    -18.19154800   -0.40557900    0.57465000
C    -17.70593200    0.87349500    0.16061500
C    -18.58554200    1.97930500   -0.00801500
C    -19.93386300    1.84559500    0.21969000
C    -17.29935700   -1.49711400    0.74972200
C    -15.95352200   -1.35985500    0.51928700
C    -15.42939300   -0.10604200    0.09246300
C    -16.32117400    0.95264900   -0.05787800
C    -14.11371300    0.43456900   -0.18052100
C    -14.33076200    1.84220100   -0.50717400
O    -15.70414000    2.10494400   -0.42115500
C    -21.81504700    0.10388900    0.95201600
C    -21.56365600   -1.36148200    1.30970200
O    -20.22517800   -1.62652500    1.19020900
O    -22.35166100   -2.19556600    1.64607100
O    -13.58689800    2.73629100   -0.84296600
C    -11.52014200    0.38475600   -0.17745400
C    -10.63324500   -0.70222000   -0.21109700
C     -9.24735800   -0.60369600   -0.16460300
C     -8.72523700    0.72714200   -0.06929800
C     -9.60369100    1.85173600   -0.02656400
C    -10.96136700    1.69643600   -0.07601000
C     -8.36220600   -1.72548800   -0.20794400
C     -7.00643000   -1.57180800   -0.15365200
C     -6.44754500   -0.25861600   -0.04634900
C     -7.33821100    0.82032300   -0.02018300
C     -5.12321000    0.30921100   -0.03112300
C     -5.34888200    1.79477100    0.03276100
O     -6.70052300    2.03209600    0.04116500
C    -12.84137900   -0.16793400   -0.18990400
C    -12.65272400   -1.62707200   -0.25983200
O    -11.28848400   -1.89419000   -0.27101700
O    -13.43509300   -2.54502000   -0.33411300
O     -4.57471600    2.70735000    0.11221900
H    -18.16131500    2.92726300   -0.32151700
H    -20.60469600    2.68963800    0.09005400
H    -17.70575600   -2.45057000    1.07058900
H    -15.28663400   -2.20115800    0.64192600
H    -22.52458900    0.14802000    0.11850000
H    -22.28483600    0.60133100    1.80757800
H     -9.16632000    2.84185400    0.04782400
H    -11.61884300    2.55359000   -0.05737400
H     -8.79855100   -2.71558000   -0.28660800
H     -6.35480800   -2.43101700   -0.18053100
*

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发表于 Post on 2025-7-2 09:33:03 | 只看该作者 Only view this author
水庐小亚 发表于 2025-7-2 09:02
我用orca尝试计算了Bipolaron的ROCIS,我预留了800G的磁盘空间,即使只设置了NRoots 10和MaxDim 5,最终 ...

耗硬盘多确实是ROCIS的硬伤。这种情况下最好的方法应该就是改用BDF做X-TDDFT了
Zikuan Wang
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