IGM分析isovalue如何正确设置？

wangtao12321 · 发表于 Post on 2025-7-11 15:45:29

本帖最后由 wangtao12321 于 2025-7-11 15:56 编辑

老师，您好！我正在使用Multiwfn进行分子间的IGM分析，导出cub文件后计划使用VMD进行可视化。我想请教一下，如何确定H键、范德华力和π-π相互作用的isovalue设置范围，这个在色坐标上很难区分范德华力与pi-pi相互作用？感谢您的指导！

sobereva · 发表于 Post on 2025-7-12 00:43:10

仔细把下文看了就明白了
谈谈pi-pi相互作用
http://sobereva.com/737（http://bbs.keinsci.com/thread-51636-1-1.html）

另外，强烈建议改用IGMH（http://sobereva.com/621），如果体系大耗时高的话用mIGM（耗时和IGM相同而效果好得多。Multiwfn最新版手册里搜mIGM了解相关信息）

Stardust0831 · 发表于 Post on 2025-7-12 00:50:53

参考https://doi.org/10.1002/anie.200705157，pi-pi相互作用本来就属于范德华相互作用。建议看看社长的这篇帖子《谈谈pi-pi相互作用》
如果是氢键，可以看到颜色会偏蓝，还可以尝试做AIM分析来讨论氢键强弱。见《透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍》

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