有没有什么方法可以分解分子内的片段间相互作用？

fy_111 · 发表于 Post on 2025-7-15 12:09:57

各位老师好！

我最近在做分子内相互作用分析，分子内的片段间因为空间位阻的作用使得静电引力和立体排斥同时存在，在这里想咨询一下各位老师有没有办法可以将该作用力分解，量化引力和斥力的强弱？实现分子内引力斥力强弱的对比，及分子间彼此横向对比

谢谢各位老师

yflchx · 发表于 Post on 2025-7-15 12:34:50

PSI4里面有Intramolecular SAPT，

输入文件容易出现问题，多尝试，trial and error。

fy_111 · 发表于 Post on 2025-7-15 17:10:15

yflchx 发表于 2025-7-15 12:34
PSI4里面有Intramolecular SAPT，

输入文件容易出现问题，多尝试，trial and error。

谢谢！我去研究研究

-HMDS- · 发表于 Post on 2025-7-15 22:17:02

http://sobereva.com/667
http://sobereva.com/252 静电势分析, 范德华表面相互穿透距离, 范德华势

sobereva · 发表于 Post on 2025-7-16 11:43:45

能用什么方法和具体体系、相互作用类型关系极大，必须尽可能交代出来
比如很多情况都可以用基于力场的能量分解分析说明这个
使用Multiwfn做基于分子力场的能量分解分析
http://sobereva.com/442（http://bbs.keinsci.com/thread-10907-1-1.html）

fy_111 · 发表于 Post on 2025-7-17 21:05:09

sobereva 发表于 2025-7-16 11:43
能用什么方法和具体体系、相互作用类型关系极大，必须尽可能交代出来
比如很多情况都可以用基于力场的能量 ...

谢谢Sob老师的回复，分子结构附图所示，我想要研究黄色和灰色片段间的相互作用，这两个片段间同时存在静电引力（羰基和胺）和立体排斥（原子距离小于范德华半径和）相互作用。
想请教一下老师这种片段划分方式是否合理？不合理的话如何划分会更好呢？或者说这种多环芳烃间的弱相互作用不适合使用能量分解的方法去研究？

sobereva · 发表于 Post on 2025-7-18 06:15:42

fy_111 发表于 2025-7-17 21:05
谢谢Sob老师的回复，分子结构附图所示，我想要研究黄色和灰色片段间的相互作用，这两个片段间同时存在静 ...

这么划分可以用Multiwfn做EDA-FF能量分解。此方法的唯一要求是能满足两个片段之间的原子相隔不少于三个化学键，当前是满足的

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[波函数分析求助] 有没有什么方法可以分解分子内的片段间相互作用？