关于biphenylene network 建模问题

屁屁桶

想建一个联苯的模型 但是不知道能否从数据库导入还是直接绘制联苯烯网络的基本单元

https://science.sciencemag.org/content/372/6544/852
https://doi.org/10.1016/j.fuel.2023.129652
https://doi.org/10.1016/j.ijhydene.2024.07.275

Uus/pMeC6H4-/キ

从空间群看等效碳原子也就两个，根据晶胞参数和键长换算成分数坐标，在VESTA里搭一下也就两分钟不到的事情。c轴方向故意设成10埃是为了足够大而不代表最优层间距。
biphenylene_network.cif (1.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

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屁屁桶

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-8-14 15:32
从空间群看等效碳原子也就两个，根据晶胞参数和键长换算成分数坐标，在VESTA里搭一下也就两分钟不到的事情 ...

我把这个建模导入MS后进行扩胞 我想留下单层联苯 但是MAKE P1后发现整体都删除了

Uus/pMeC6H4-/キ

屁屁桶 发表于 2025-8-14 19:34
我把这个建模导入MS后进行扩胞 我想留下单层联苯 但是MAKE P1后发现整体都删除了

无论是建模还是计算，我都不用M$的。直接看cif文本文件就会发现里面只有两个碳原子，显然就已经是单层了，你看到的效果是因为(1)软件把碳原子放在盒子边界，且(2)软件把盒子边界上的原子显示在两端，而不是按实际组成只显示一个。另外用截屏代替拍照更好。