分子大小和分子内径的大小怎么算？

心辉 · 发表于 Post on 2019-8-20 20:17:33

请问各位老师，在算高斯的时候有个同学问我，如果给定一个分子结构，这个结构在空间的长宽高是是多少怎么测量呢？
比如说一个苯分子，长度宽度和厚度各是多少，或者是画出来的一个冠醚内径是多少，这些要怎么算和求？

captain · 发表于 Post on 2019-8-20 20:41:33

本帖最后由 captain 于 2019-8-20 20:46 编辑

谈谈分子半径的计算和分子形状的描述 http://sobereva.com/190
使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分子的主轴 http://sobereva.com/426
使用Multiwfn计算分子的动力学直径 http://sobereva.com/503

Shine剪水 · 发表于 Post on 2019-8-20 21:42:41

对于内径大小的测量，如果分子的对称性比较好的话，可以取晶体结构或者建模优化后，选合适的原子测量距离，然后结合captain老师给的链接里面的思路进行测量。

心辉 · 发表于 Post on 2019-8-21 10:38:28

captain 发表于 2019-8-20 20:41
谈谈分子半径的计算和分子形状的描述 http://sobereva.com/190
使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分 ...

谢谢

心辉 · 发表于 Post on 2019-8-21 10:38:39

Shine剪水发表于 2019-8-20 21:42
对于内径大小的测量，如果分子的对称性比较好的话，可以取晶体结构或者建模优化后，选合适的原子测量距离， ...

谢谢

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