计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2262|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 计算晶胞优化时固定角度失效

[复制链接 Copy URL]

7

帖子

0

威望

77

eV
积分
84

Level 2 能力者

本帖最后由 qli0218 于 2024-7-1 16:42 编辑

如题,在输入文件中:KEEP_ANGLES T 设置角度固定,但是发现计算过程中,角度却是发生变化的。
所以请问这个是怎么回事,为什么固定不了?


另外还有一个小问题,有没有办法让abc三个晶胞常数一起发生变化,想让盒子的abc一直相等。谢谢

result.out

430.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

coor.txt

5.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

CeOHYS2.inp

5.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126549

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-7-1 18:28:40 | 只看该作者 Only view this author
你的晶胞定义不满足习俗
习俗应当a轴平行于X轴。我利用gview重新对晶轴做了变换以满足这一点并产生了新的CP2K输入文件,现在没有任何问题,始终能保持都是60度

CeOHYS2.inp

14.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

CeOHYS2.out

55.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

7

帖子

0

威望

77

eV
积分
84

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-1 19:43:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-1 18:28
你的晶胞定义不满足习俗
习俗应当a轴平行于X轴。我利用gview重新对晶轴做了变换以满足这一点并产生了新的C ...

非常感谢

1329

帖子

6

威望

2817

eV
积分
4266

Level 6 (一方通行)

傻傻的木瓜

4#
发表于 Post on 6 hour ago | 只看该作者 Only view this author
类似问题在https://github.com/cp2k/cp2k/issues/3384有解释了,在CP2K里变胞优化的算法设计就没有考虑兼容不符合约定的盒子。这里的约定“第一个晶格矢量A平行于X轴、第二个晶格矢量B在XY平面,三个晶格矢量A, B, C构成下三角形矩阵”在最新版本的手册里有所强调,且最新版本的CP2K在读到不符合约定的晶格矢量定义时会弹警告。

除了建模时就做晶格矢量变换获得符合约定的盒子外,也可以改成用&CELL字段下ABC和ALPHA_BETA_GAMMA直接定义晶胞参数的写法搭配&COORD字段下SCALED T用分数坐标定义原子位置的设置,此时CP2K会自动构建符合约定的盒子并得到正确的原子笛卡尔坐标。

若要在变胞优化时保持盒子的对称性【此处“对称性”仅指晶胞参数的关系,如RHOMBOHEDRAL(菱方)有三个晶格矢量长度相等、三个夹角相等且非直角的关系,与需要spglib结合原子位置识别的空间群不是一回事】,则需同时在&CELL/SYMMETRY设定对称性、&CELL_OPT/KEEP_SYMMETRY启用对称性的约束。
√546=23.36664289109

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-27 18:53 , Processed in 0.232681 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list