计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 45|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 使用fchred的过程中遇到fortran报错,如何处理?

[复制链接 Copy URL]

22

帖子

0

威望

744

eV
积分
766

Level 4 (黑子)

本帖最后由 yaonaite 于 2026-5-1 15:33 编辑

在gaussian任务正常结束后,fchk文件大小为72.4 GB,希望使用fchred进行转换。但遇到了fortran的报错,有大佬遇到过这样的问题吗?如何处理?

原计算任务:
#p td=(nstates=100) b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3bj g09default

报错信息为
forrtl: severe (64): input conversion error, unit -5, file Internal List-Directed Read


使用该文件的意图是:作部分重要的轨道图像、读轨道能量、作电子激发分析

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126626

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on yesterday 15:32 | 只看该作者 Only view this author
检查文件末尾是否完整
如果文件被破坏、数据有异常(被记录为星号)等都可能导致fchred读取失败
处理大体系之前先用同样的关键词搞小体系进行测试

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
yaonaite + 3 谢谢分享

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

22

帖子

0

威望

744

eV
积分
766

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 15:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-1 15:32
检查文件末尾是否完整
如果文件被破坏、数据有异常(被记录为星号)等都可能导致fchred读取失败
处理大体 ...

感谢社长的回答!
较小的体系(没有很小,fchk文件也在数十GB量级)进行的同关键词计算没有出现该问题,能够正常转换。
该文件似乎超过了geany能打开的极限,看不了数据有没有问题,是否有别的软件可看呢?

另外,如果使用同一博文中介绍的使用multiwfn转换的方法,不会报错,转换出的fch格式文件会比fchred报错后转换出的文件更小一些(359MB vs 717MB),请问老师这个文件是不是也足够用呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126626

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on yesterday 17:15 | 只看该作者 Only view this author
yaonaite 发表于 2026-5-1 15:50
感谢社长的回答!
较小的体系(没有很小,fchk文件也在数十GB量级)进行的同关键词计算没有出现该问题, ...

Multiwfn转出来的fch文件不会包含组态系数信息

用tail命令可以输出最后部分
ultraedit可以快速打开巨大文件
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

22

帖子

0

威望

744

eV
积分
766

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 23:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-1 17:15
Multiwfn转出来的fch文件不会包含组态系数信息

用tail命令可以输出最后部分

原fchk文件的末尾是:
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
Gaussian Version                           C   N=           2
ES64L-G16RevC.01
看上去和能正常转换的文件末尾是一样的。

我对比了转换出的新的fchk文件,发现报错的那些文件最终写到Excited state spins字段的末尾就会截止,就是说会缺少Mulliken Charges及之后的字段。随后我使用tail命令输出了最后5000行(此时已经能完整看到原fchk文件的Mulliken Charges及之后的字段),并未发现有数据变成*的问题。

请问老师我有办法进一步定位问题吗?是不是把原fchk文件的这个字段直接粘贴进新的(转换过程中报错的)fchk文件末尾也能得到预期的新fchk文件?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-5-2 03:21 , Processed in 0.324586 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list