计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4920|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] CCSD(T)算到最后一步总是会停止

[复制链接 Copy URL]

410

帖子

0

威望

2519

eV
积分
2929

Level 5 (御坂)

CCSD(T)算到最后一步,很快程序就停了,LOG文件没有提示,但是提交任务的BATCH文件有错误提示
Error: cannot allocate team structure
  --- traceback not available


我重复了3次都是这样,之前一些较小的体系都能够正常结束,这次这个体系稍大,怎么算都会停,这是怎么回事?

202110212247447304..png (21.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

202110212247447304..png

4289

帖子

4

威望

9550

eV
积分
13919

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2021-10-21 23:58:13 | 只看该作者 Only view this author
那就是CCSD部分,或者(T)部分,你给的内存不够呗。有内存就增大内存。另外,每个人的“稍大”是不一样的,应该具体讲多少原子、什么基组
自动做多参考态计算的程序MOKIT

205

帖子

0

威望

1732

eV
积分
1937

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2021-10-22 13:54:52 | 只看该作者 Only view this author
CCSD(T)算算10个原子左右的还行,20个原子的体系就已经很慢了
Shanghai JiaoTong University
欢迎关注我的推送号:AI计算生化

410

帖子

0

威望

2519

eV
积分
2929

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-22 14:35:41 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-10-21 23:58
那就是CCSD部分,或者(T)部分,你给的内存不够呗。有内存就增大内存。另外,每个人的“稍大”是不一样的, ...

C4H7N9O4,17个非氢原子
CCSD(T)/def2-tZVPP
给了50GB内存

410

帖子

0

威望

2519

eV
积分
2929

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-22 14:36:36 | 只看该作者 Only view this author
lijiayisjtu 发表于 2021-10-22 13:54
CCSD(T)算算10个原子左右的还行,20个原子的体系就已经很慢了

C4H7N9O4,17个非氢原子
CCSD(T)/def2-tZVPP
给了50GB内存,24核,算5天左右能够到图上这一步

4289

帖子

4

威望

9550

eV
积分
13919

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

6#
发表于 Post on 2021-10-22 14:40:22 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2021-10-22 14:36
C4H7N9O4,17个非氢原子
CCSD(T)/def2-tZVPP
给了50GB内存,24核,算5天左右能够到图上这一步

那你应该用ORCA的DLPNO-CCSD(T) (注意只写这一个关键词通常不够,要考虑TightSCF, TightPNO, T1等等其他关键词)。总不至于以“不了解ORCA”、“还不会用ORCA”为理由不用吧,现在都2021年了,时代不一样了
自动做多参考态计算的程序MOKIT

410

帖子

0

威望

2519

eV
积分
2929

Level 5 (御坂)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-22 14:45:02 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-10-22 14:40
那你应该用ORCA的DLPNO-CCSD(T) (注意只写这一个关键词通常不够,要考虑TightSCF, TightPNO, T1等等其他 ...

但是其他物种都是用Gaussian算的,如果换成ORCA就得全部重算,10多个物种算下来太慢了
是内存不够吗,可以再加一点内存

194

帖子

0

威望

3694

eV
积分
3888

Level 5 (御坂)

8#
发表于 Post on 2021-10-22 14:52:17 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2021-10-22 14:45
但是其他物种都是用Gaussian算的,如果换成ORCA就得全部重算,10多个物种算下来太慢了
是内存不够吗,可 ...

Gaussian上(T)可能需要更多的时间...

4289

帖子

4

威望

9550

eV
积分
13919

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

9#
发表于 Post on 2021-10-22 14:55:15 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2021-10-22 14:45
但是其他物种都是用Gaussian算的,如果换成ORCA就得全部重算,10多个物种算下来太慢了
是内存不够吗,可 ...

如果你连CCSD部分都没算完,更不可能算完(T)部分。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

4289

帖子

4

威望

9550

eV
积分
13919

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

10#
发表于 Post on 2021-10-22 14:56:41 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2021-10-22 14:45
但是其他物种都是用Gaussian算的,如果换成ORCA就得全部重算,10多个物种算下来太慢了
是内存不够吗,可 ...

不需要重算,只需要算这一个,CCSD(T)全世界都是一样的(关键词合理,所有收敛阈值够紧),DLPNO-CCSD(T1)极度接近CCSD(T),你自己算一个3个原子的体系看看就知道了。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

410

帖子

0

威望

2519

eV
积分
2929

Level 5 (御坂)

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-22 17:03:58 | 只看该作者 Only view this author
scf 发表于 2021-10-22 14:52
Gaussian上(T)可能需要更多的时间...

这个不是时间不够,是计算直接停了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 09:15 , Processed in 0.222452 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list