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[GROMACS] 请教:如何修改有机小分子的拓扑文件

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我用Automated Topology Builder生成了两个有机小分子的拓扑文件,GROMOS96 G54A7力场。但不知道如何判断生成的文件是否正确,恳请各位老师帮助。 drg3.itp (7.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)
drg8.itp (7.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)


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发表于 Post on 2019-9-5 22:59:59 | 只看该作者 Only view this author
你跑一下试试就知道了

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3#
发表于 Post on 2019-9-6 01:31:34 | 只看该作者 Only view this author
一般不会有异常,就算有一些问题,肉眼一般也看不出来。先跑EM和MD,如果结果看着没问题就说明合理,有问题再去仔细检查

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李德贤 + 5 谢谢

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