采用关键词freq=intmodes，分析键长、键角、二面角对重组能贡献的疑惑

qinxiaodao · 发表于 Post on 2021-9-10 14:02:43

如题，看到一篇分析分子的键长键角二面角对重组能的贡献的文献，文中没说处理方法。按照之前sob老师回复的帖子（如何分析键长、键角、二面角对重组能的贡献？http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 26&fromuid=9185(出处: 计算化学公社)）做了测试，有以下几个疑惑：1.每个正则模式下键长键角二面角的relative weight 总和为什么不是1？ 2.具体算法是否有误：我是先用dushin计算分解了总的重组能，之后，分析每一个正则模式下，键长键角二面角的总占比（根据relative weight权重的占比计算的，不是按照1算的，总的加起来是多少就除多少）,然后在找到该模式下对应的对重组能的贡献，就的到该模式下，键长键角二面角的贡献。这样就得到了所有的键长键角二面角对重组能的贡献。但是结果相差很多，尤其是键长的。

PS:我做的是THF里的。感谢各位老师同学解惑。

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-11 03:21:33

1 贡献大于特定值的项才会输出。所以你会发现每个振动模式显示的项数往往是不同的
2 可能作者把各个冗余内坐标的力常数的差异问题考虑了进去

qinxiaodao · 发表于 Post on 2021-9-14 10:18:58

sobereva 发表于 2021-9-11 03:21
1 贡献大于特定值的项才会输出。所以你会发现每个振动模式显示的项数往往是不同的
2 可能作者把各个冗余内 ...

非常感谢sob老师，很抱歉没能及时感谢您。我还有两个问题想请教您：考虑冗余内坐标的话是不是在关键词位置处添加opt=redundant呢？对于这种分析键长键角对重组能的贡献的研究，那种更合理一些呢？想确认一下我测试的方法是不是合理的。再次感谢sob老师！

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-15 01:31:42

qinxiaodao 发表于 2021-9-14 10:18
非常感谢sob老师，很抱歉没能及时感谢您。我还有两个问题想请教您：考虑冗余内坐标的话是不是在关键词位 ...

本来默认就是在冗余内坐标下做的，intmodes给的也是冗余内坐标的贡献
考虑力常数的差异更合理

qinxiaodao · 发表于 Post on 2021-9-15 16:09:47

sobereva 发表于 2021-9-15 01:31
本来默认就是在冗余内坐标下做的，intmodes给的也是冗余内坐标的贡献
考虑力常数的差异更合理

好哒，谢谢sob老师！

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