五万内的服务器配置，本人新人，求各位大神给看看，这配置咋样？

薛定谔的老猫

我们组主要用Gaussian做一些关于量子点的形成机理的第一性原理的计算，需要购入服务器，现戴尔给出如下配置：
1.服务器:戴尔presion双路塔式服务器
2处理器:两颗IntexeonE52696v3单节点共计36核心CPU,主频2.3GHz
3.内存选项:128GBDDR42400MHzRECC
4.存储:1块250GBS5D固态硬盘作为系统盘
1块4TBS5ATA7200PM128M缓存6GB/5企业级硬盘作为存储空间
光驱选项:超薄刻录光驱
6.显卡选项:NdaQuadoK6202G8DDR3显存,拥有384个CUDA核心
7.键盘:De原厂键鼠

报价48800
麻烦各位大神看一下值不值得？非常感谢了 。

keke1234

肯定不值。那个显卡K620, 几百元就能买了。

asdermnb110

楼主哪里的，找大神写个配置就好，何必血亏两万呢，你的商家应该不会只卖戴尔的，问下他组装的也可以嘛

薛定谔的老猫

luktian 发表于 2018-6-3 14:25
同新人，分享自己的想法：
我自己在TB上买的二手服务器，2012年的机子。
配置：

您好，非常感谢您的建议，关于显卡的问题，我和商家谈过了，因为是他们的附属品，所以就没考虑去除了，不要白不要嘛，哈哈，目前主要是我一个人在做过渡态的计算，不过以后需要进行药物方面的一些计算，所以内存考虑的比较大。

tomwong4253

luktian 发表于 2018-6-4 15:42
感谢前辈的更正：
第一点：显卡部分我的认知还只局限于民用卡，对专业卡的认知太少和片面了；
第三点： ...

萌新尼豪～～我也是新人（滑稽）
共同进步共同进步

如果有学校服务器资源的话，自己配的这些确实够了，毕竟过大过重的任务可以有地方算了

luktian

tomwong4253 发表于 2018-6-4 13:07
刚好看到了这位老师or童鞋的回答，有几点补充请参考：

1. Quadro确实不适合用来做MD类的计算，我对显 ...

感谢前辈的更正：
第一点：显卡部分我的认知还只局限于民用卡，对专业卡的认知太少和片面了；
第三点：由于是自己买来自己用（学校服务器是主要的资源），所以才选择性价比的路线。我也觉得二手货是需要靠运气才能下手，我买的TB店是之前有师兄趟过这个浑水并稳定运行了3年以上才敢进去买的。。。所以我也觉得您说得更在理。
第四点：之前买的时候也没注意到这个问题，感谢您的更正！
第五点：我没有理解楼主买SSD盘的意思，感谢您的更正！

前辈您好！我是童鞋，新人

tomwong4253

luktian 发表于 2018-6-3 14:25
同新人，分享自己的想法：
我自己在TB上买的二手服务器，2012年的机子。
配置：

刚好看到了这位老师or童鞋的回答，有几点补充请参考：

1. Quadro确实不适合用来做MD类的计算，我对显卡的配置意见和你有所不同，不建议你这种走极端的“要么没有，要么就有Tesla”的配置方法。其实MD计算领域，1080或1080Ti（根据预算而定）做MD模拟已经是非常好的选择了。并且因为其架构是最新的，跑出超过Tesla的速度完全是可能的。有一点不同就是它们的显存不是像Tesla或者Quadro那样的ECC显存，在极个别非常少的情况下会有显存错误导致的模拟中断。不过，我个人在用Tesla的时候也是关掉ECC显存使用，因为真出了错导致作业中断，从出错地方restart就是了。想想Tesla一块够你买多少1080或者1080Ti就知道了。

我目前能想到的Tesla使用的地方：1） 非MD类的不可中断的计算（如部分使用GPU加速的生信分析），这些作业一旦中断就只能从头开始，所谓不怕一万就怕万一，用Tesla显然有优势，否则做了十天半月突然从头开始，耽误时间。2）Tesla显存大，在非常巨大的MD体系的模拟，别的显卡显存不够用的情况下，只能用Tesla。不过，如果你以后用的到针对Quadro驱动优化过的软件的话，显卡请选择Quadro。只要针对老黄家的驱动优化过的软件，速度是会比1080Ti快得多的。

2. 内存大小这点我完全赞同你的意见，除非你的机器还要兼做比如生信分析这种耗内存的工作，一般64G足矣应付大多数任务。

3. 内存DDR3是否够，确实E5 V2+X79板子+DDR3是一个做Gaussian性价比极高的组合。但是正所谓“买新不买旧”，X79板子除了某宝上的华南寨板之外（华南寨板还只有单路），现在全是存货或者二手货。主板可以说是整个机器里除了硬盘之外第二容易损坏的部分了，存货或者二手货的暗病什么的，如果不是老手或测试不充分，万一在某个时间爆发出来，弄得批经费的领导/老板不高兴事情小，耽误自己科研事情大。因此在预算不是特别紧张的情况下，我个人真心推荐能新尽量用v3 v4的平台。毕竟主板什么的都是新货。

4. 如果将来会涉及一些其他的应用，v2系列的CPU缺乏AVX2指令集，不少基于这个指令集的新版软件是没法运行的。这点是v2系列CPU的致命弱点。万一将来有个新版软件你一定要用，却只能在AVX2指令集上运行，那还要重新买。

5. linux系统没有“系统盘”（也就是C盘）一说，完全可以SSD+机械，只要把几个读写频繁的目录挂载在SSD上（所谓的“苦力盘”）完全是可以的，社长博文也有写到“苦力盘”的作用。全SSD的配置除非钱多的花不完，否则没有必要。

luktian

同新人，分享自己的想法：
我自己在TB上买的二手服务器，2012年的机子。
配置：
E5-2680 V2 2.8GHz 20虚核 双路共40虚核
硬盘 1T 企业
内存32GB DDR3
没有显卡（服务器自带只能显示命令窗口）
算上运费7000元，主要计算Gaussian和Vasp，同核下速度比学校的服务器快不少，就是不能自己装不来作业调度系统。

个人建议：
1）不考虑显卡计算就不要买显卡，不然就应该更高级的专业显卡，您配置里的显卡显然是坑货；
2）考虑一下使用人数和单个作业的计算量。如我是自己一个人算，一个Gaussian作业4G内存，那么我的内存32G就足以；一个Gaussian作业容量是MB量级，1TB对我也就够了。因此内存128GB考虑一下是否太大了，内存是影响价格很大的因素之一。
3）内存DDR3是否也够了？目前计算瓶颈应该是在硬盘读写能力上而非内存速度上。
4）关于SSD，由于瓶颈在于任务读写到机械硬盘的速度上，因此只有系统盘是SSD似乎没有什么太大用。要么全部是机械硬盘，要么全是SSD硬盘。

个人拙见，有错请轻喷

zyzhang

薛定谔的老猫 发表于 2018-6-1 13:29
恩恩，差不多亏了两万，主要我刚接触没几天，不会自己组装

其实并不难
首先硬件层面上并不需要你动手组装攒机。找家靠谱的淘宝店，让他们按照你需要的配置装配。而且有些硬件他们能以更便宜的价格拿到，总价下来甚至要比我们自己攒机便宜。具体可以参考卢老师的这篇博文http://bbs.keinsci.com/thread-6310-1-1.html
软件层面上自己动手装个CentOS，编译好Gaussian、VASP等你常用的程序，这样就OK了。

另外不要幻想着供应商他们能够提供多么体贴的服务，在服务器硬件没问题的前提下（电脑硬件也不容易出问题），他们也仅限于能够帮你装个系统、调试个网络，最多好的再帮你编译上量化软件（通常他们技术很一般。。火兰。。），这些东西不值得也没必要花大价钱让别人弄，自己动手两三小时足矣。

最后，根据你提供的配置单，给你提供以下几点建议：
1、处理器方面：目前至强E5-2696 v3性价比不如E5-2686 v4，二者性能差不多，后者更新不是
2、内存方面：目前的行情相较于去年是有所下降，但还在坡上。同时一般的体系64GB足矣，等内存价格下来了，再考虑增加到128GB，现在不是买内存的时候。
3、固态硬盘方面：根据自己的计算体系、方法，进行取舍。详情可以参考老师的这篇博文http://bbs.keinsci.com/thread-7478-1-1.html
4、机械硬盘方面：900元买块4TB硬盘足矣。不要做RAID0，RAID0运行时只要其中任意一块硬盘出现问题就会导致整个数据的故障，不建议使用，数据无价。如果对速度敏感上SSD
5、显卡方面：同样根据自己计算的内容取舍。如果不跑MD，集成显卡或者亮机卡足矣；如果跑MD，建议配一块GTX1080甚至GTX1080Ti加速。

tomwong4253

薛定谔的老猫 发表于 2018-6-1 13:39
好的，非常感谢，吓死宝宝了

不过哥几个推荐你自己组装，主要考虑到万一奸商用ES QS版去敷衍你，而你没注意的话，那就真亏2-3万了。一定要跟经销商定死是正式版，千万别是ES QS版，那些版本便宜太多。奸商会血赚。
此外，品牌的主板的质量也不太好保证，要跟经销商谈好质保的问题。而且万一经销商一两年跑路不干了，你万一主板跪了都没处修。

abin

如果是戴尔全套，并且是你写的配置， 价格还是可以的。
至少包含了3年硬件质保的。

另， 可以建议， 在价格变化不大的情况下， 机械硬盘采用两块，做RAID0， 速度有显著提升。

薛定谔的老猫

tomwong4253 发表于 2018-6-1 13:30
是这个解释，我反复眼花中。
两颗CPU一块主板就是双路的意思。
如果你确定是两颗2696v3正式版，那你这 ...

好的，非常感谢，吓死宝宝了

tomwong4253

薛定谔的老猫 发表于 2018-6-1 13:23
我以为双路是指CPU的个数，两个cpu就是双路，网上查了都是这个解释啊，请问如果不是这样，那该怎么理解双 ...

是这个解释，我反复眼花中。
两颗CPU一块主板就是双路的意思。
如果你确定是两颗2696v3正式版，那你这个配置还是问题不大的。
主要是确定下显卡是否是必须的，目前Gaussian跟显卡还不是很搭的。何况经销商给你的还是上代K系列。怀疑在坑你的钱。。。不要显卡的话，这价钱还是可以的

顺便，上面说2-3W能拿双路2696v3的正式版兄弟，麻烦show一下经销商给你的CPU报价。至少我掌握的信息，2696v3 CPU正式版还是全线缺货状态，有货的一颗也要上万，光两个CPU就2万了，128G内存起码还得1万多，加上别的配件，你3万能拿下来这台？

薛定谔的老猫

zyzhang 发表于 2018-6-1 13:03
水分太大，目前这配置自行组装2.5~3万元就能搞定

恩恩，差不多亏了两万，主要我刚接触没几天，不会自己组装

薛定谔的老猫

tomwong4253 发表于 2018-6-1 13:01
没写主板，是DELL自己的主板么？
显卡没必要Quadro，如果以后不做MD，显卡基本上不需要，集显（如果有）足 ...

我以为双路是指CPU的个数，两个cpu就是双路，网上查了都是这个解释啊，请问如果不是这样，那该怎么理解双路呢？非常抱歉啊，刚刚接触几天