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[配置讨论] 五万内的服务器配置,本人新人,求各位大神给看看,这配置咋样?

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发表于 2018-6-1 12:23:50 | 显示全部楼层 |阅读模式
我们组主要用Gaussian做一些关于量子点的形成机理的第一性原理的计算,需要购入服务器,现戴尔给出如下配置:
1.服务器:戴尔presion双路塔式服务器
2处理器:两颗IntexeonE52696v3单节点共计36核心CPU,主频2.3GHz
3.内存选项:128GBDDR42400MHzRECC
4.存储:1块250GBS5D固态硬盘作为系统盘
1块4TBS5ATA7200PM128M缓存6GB/5企业级硬盘作为存储空间
光驱选项:超薄刻录光驱
6.显卡选项:NdaQuadoK6202G8DDR3显存,拥有384个CUDA核心
7.键盘:De原厂键鼠

报价48800
麻烦各位大神看一下值不值得?非常感谢了 。

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发表于 2018-6-1 12:59:32 | 显示全部楼层
血亏

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发表于 2018-6-1 13:01:19 | 显示全部楼层
本帖最后由 tomwong4253 于 2018-6-1 13:09 编辑

没写主板,是DELL自己的主板么?
显卡没必要Quadro,如果以后不做MD,显卡基本上不需要,集显(如果有)足够。
这样可能4W多点就拿到了。如果需要显卡做MD,而且不是主要做MD,搭配一块2-3K的1065或者5K左右的1080足矣。
4W8没必要。
没注意看是单路????那亏大发了
双路2696v3的这个价钱还差不多,单路的至少亏上万

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发表于 2018-6-1 13:03:36 | 显示全部楼层
水分太大,目前这配置自行组装2.5~3万元就能搞定

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发表于 2018-6-1 13:13:35 | 显示全部楼层
本帖最后由 tomwong4253 于 2018-6-1 13:30 编辑

给你个部件的大概价钱供参考:

CPU 2696v3正式版  不含税10000  含增值税可能要12000
超微双路X10DRL/DAL 双路板子,含税大概3500
超微X10SRL,单路板子,含税大概3000
内存,三星的16G一条 含税1650,128G就乘以8,大概13000左右
电源台达650W    含税不到800
机箱先马坦克大概含税 300
硬盘 固态 600多 机械 4T 大概1300多
别的小部件就不算了。


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 楼主| 发表于 2018-6-1 13:23:21 | 显示全部楼层
tomwong4253 发表于 2018-6-1 13:01
没写主板,是DELL自己的主板么?
显卡没必要Quadro,如果以后不做MD,显卡基本上不需要,集显(如果有)足 ...

我以为双路是指CPU的个数,两个cpu就是双路,网上查了都是这个解释啊,请问如果不是这样,那该怎么理解双路呢?非常抱歉啊,刚刚接触几天

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 楼主| 发表于 2018-6-1 13:29:43 | 显示全部楼层
zyzhang 发表于 2018-6-1 13:03
水分太大,目前这配置自行组装2.5~3万元就能搞定

恩恩,差不多亏了两万,主要我刚接触没几天,不会自己组装

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发表于 2018-6-1 13:30:21 | 显示全部楼层
薛定谔的老猫 发表于 2018-6-1 13:23
我以为双路是指CPU的个数,两个cpu就是双路,网上查了都是这个解释啊,请问如果不是这样,那该怎么理解双 ...

是这个解释,我反复眼花中。
两颗CPU一块主板就是双路的意思。
如果你确定是两颗2696v3正式版,那你这个配置还是问题不大的。
主要是确定下显卡是否是必须的,目前Gaussian跟显卡还不是很搭的。何况经销商给你的还是上代K系列。怀疑在坑你的钱。。。不要显卡的话,这价钱还是可以的

顺便,上面说2-3W能拿双路2696v3的正式版兄弟,麻烦show一下经销商给你的CPU报价。至少我掌握的信息,2696v3 CPU正式版还是全线缺货状态,有货的一颗也要上万,光两个CPU就2万了,128G内存起码还得1万多,加上别的配件,你3万能拿下来这台?

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 楼主| 发表于 2018-6-1 13:39:40 | 显示全部楼层
tomwong4253 发表于 2018-6-1 13:30
是这个解释,我反复眼花中。
两颗CPU一块主板就是双路的意思。
如果你确定是两颗2696v3正式版,那你这 ...

好的,非常感谢,吓死宝宝了

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发表于 2018-6-1 13:44:09 | 显示全部楼层
如果是戴尔全套,并且是你写的配置, 价格还是可以的。
至少包含了3年硬件质保的。

另, 可以建议, 在价格变化不大的情况下, 机械硬盘采用两块,做RAID0, 速度有显著提升。

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发表于 2018-6-1 13:44:39 | 显示全部楼层
薛定谔的老猫 发表于 2018-6-1 13:39
好的,非常感谢,吓死宝宝了

不过哥几个推荐你自己组装,主要考虑到万一奸商用ES QS版去敷衍你,而你没注意的话,那就真亏2-3万了。一定要跟经销商定死是正式版,千万别是ES QS版,那些版本便宜太多。奸商会血赚。
此外,品牌的主板的质量也不太好保证,要跟经销商谈好质保的问题。而且万一经销商一两年跑路不干了,你万一主板跪了都没处修。

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发表于 2018-6-1 16:44:02 | 显示全部楼层
本帖最后由 zyzhang 于 2018-6-1 17:09 编辑
薛定谔的老猫 发表于 2018-6-1 13:29
恩恩,差不多亏了两万,主要我刚接触没几天,不会自己组装

其实并不难
首先硬件层面上并不需要你动手组装攒机。找家靠谱的淘宝店,让他们按照你需要的配置装配。而且有些硬件他们能以更便宜的价格拿到,总价下来甚至要比我们自己攒机便宜。具体可以参考卢老师的这篇博文http://bbs.keinsci.com/thread-6310-1-1.html
软件层面上自己动手装个CentOS,编译好Gaussian、VASP等你常用的程序,这样就OK了。

另外不要幻想着供应商他们能够提供多么体贴的服务,在服务器硬件没问题的前提下(电脑硬件也不容易出问题),他们也仅限于能够帮你装个系统、调试个网络,最多好的再帮你编译上量化软件(通常他们技术很一般。。火兰。。),这些东西不值得也没必要花大价钱让别人弄,自己动手两三小时足矣。

最后,根据你提供的配置单,给你提供以下几点建议:
1、处理器方面:目前至强E5-2696 v3性价比不如E5-2686 v4,二者性能差不多,后者更新不是
2、内存方面:目前的行情相较于去年是有所下降,但还在坡上。同时一般的体系64GB足矣,等内存价格下来了,再考虑增加到128GB,现在不是买内存的时候。
3、固态硬盘方面:根据自己的计算体系、方法,进行取舍。详情可以参考老师的这篇博文http://bbs.keinsci.com/thread-7478-1-1.html
4、机械硬盘方面:900元买块4TB硬盘足矣。不要做RAID0,RAID0运行时只要其中任意一块硬盘出现问题就会导致整个数据的故障,不建议使用,数据无价。如果对速度敏感上SSD
5、显卡方面:同样根据自己计算的内容取舍。如果不跑MD,集成显卡或者亮机卡足矣;如果跑MD,建议配一块GTX1080甚至GTX1080Ti加速。

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发表于 2018-6-3 14:25:58 | 显示全部楼层
同新人,分享自己的想法:
我自己在TB上买的二手服务器,2012年的机子。
配置:
E5-2680 V2 2.8GHz 20虚核 双路共40虚核
硬盘 1T 企业
内存32GB DDR3
没有显卡(服务器自带只能显示命令窗口)
算上运费7000元,主要计算Gaussian和Vasp,同核下速度比学校的服务器快不少,就是不能自己装不来作业调度系统。

个人建议:
1)不考虑显卡计算就不要买显卡,不然就应该更高级的专业显卡,您配置里的显卡显然是坑货;
2)考虑一下使用人数和单个作业的计算量。如我是自己一个人算,一个Gaussian作业4G内存,那么我的内存32G就足以;一个Gaussian作业容量是MB量级,1TB对我也就够了。因此内存128GB考虑一下是否太大了,内存是影响价格很大的因素之一。
3)内存DDR3是否也够了?目前计算瓶颈应该是在硬盘读写能力上而非内存速度上。
4)关于SSD,由于瓶颈在于任务读写到机械硬盘的速度上,因此只有系统盘是SSD似乎没有什么太大用。要么全部是机械硬盘,要么全是SSD硬盘。

个人拙见,有错请轻喷

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发表于 2018-6-4 13:07:35 | 显示全部楼层
本帖最后由 tomwong4253 于 2018-6-4 13:22 编辑
luktian 发表于 2018-6-3 14:25
同新人,分享自己的想法:
我自己在TB上买的二手服务器,2012年的机子。
配置:

刚好看到了这位老师or童鞋的回答,有几点补充请参考:

1. Quadro确实不适合用来做MD类的计算,我对显卡的配置意见和你有所不同,不建议你这种走极端的“要么没有,要么就有Tesla”的配置方法。其实MD计算领域,1080或1080Ti(根据预算而定)做MD模拟已经是非常好的选择了。并且因为其架构是最新的,跑出超过Tesla的速度完全是可能的。有一点不同就是它们的显存不是像Tesla或者Quadro那样的ECC显存,在极个别非常少的情况下会有显存错误导致的模拟中断。不过,我个人在用Tesla的时候也是关掉ECC显存使用,因为真出了错导致作业中断,从出错地方restart就是了。想想Tesla一块够你买多少1080或者1080Ti就知道了。

我目前能想到的Tesla使用的地方:1) 非MD类的不可中断的计算(如部分使用GPU加速的生信分析),这些作业一旦中断就只能从头开始,所谓不怕一万就怕万一,用Tesla显然有优势,否则做了十天半月突然从头开始,耽误时间。2)Tesla显存大,在非常巨大的MD体系的模拟,别的显卡显存不够用的情况下,只能用Tesla。不过,如果你以后用的到针对Quadro驱动优化过的软件的话,显卡请选择Quadro。只要针对老黄家的驱动优化过的软件,速度是会比1080Ti快得多的。

2. 内存大小这点我完全赞同你的意见,除非你的机器还要兼做比如生信分析这种耗内存的工作,一般64G足矣应付大多数任务。

3. 内存DDR3是否够,确实E5 V2+X79板子+DDR3是一个做Gaussian性价比极高的组合。但是正所谓“买新不买旧”,X79板子除了某宝上的华南寨板之外(华南寨板还只有单路),现在全是存货或者二手货。主板可以说是整个机器里除了硬盘之外第二容易损坏的部分了,存货或者二手货的暗病什么的,如果不是老手或测试不充分,万一在某个时间爆发出来,弄得批经费的领导/老板不高兴事情小,耽误自己科研事情大。因此在预算不是特别紧张的情况下,我个人真心推荐能新尽量用v3 v4的平台。毕竟主板什么的都是新货。

4. 如果将来会涉及一些其他的应用,v2系列的CPU缺乏AVX2指令集,不少基于这个指令集的新版软件是没法运行的。这点是v2系列CPU的致命弱点。万一将来有个新版软件你一定要用,却只能在AVX2指令集上运行,那还要重新买。

5. linux系统没有“系统盘”(也就是C盘)一说,完全可以SSD+机械,只要把几个读写频繁的目录挂载在SSD上(所谓的“苦力盘”)完全是可以的,社长博文也有写到“苦力盘”的作用。全SSD的配置除非钱多的花不完,否则没有必要。





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发表于 2018-6-4 15:42:00 | 显示全部楼层
tomwong4253 发表于 2018-6-4 13:07
刚好看到了这位老师or童鞋的回答,有几点补充请参考:

1. Quadro确实不适合用来做MD类的计算,我对显 ...

感谢前辈的更正:
第一点:显卡部分我的认知还只局限于民用卡,对专业卡的认知太少和片面了;
第三点:由于是自己买来自己用(学校服务器是主要的资源),所以才选择性价比的路线。我也觉得二手货是需要靠运气才能下手,我买的TB店是之前有师兄趟过这个浑水并稳定运行了3年以上才敢进去买的。。。所以我也觉得您说得更在理。
第四点:之前买的时候也没注意到这个问题,感谢您的更正!
第五点:我没有理解楼主买SSD盘的意思,感谢您的更正!

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