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[Multiwfn使用咨询] 求垂直孔洞轴心截面的长边和短边长度

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阅读了sob老师的文章:使用Multiwfn可视化分子孔洞并计算孔洞体积http://sobereva.com/408。希望能够求出垂直孔洞轴心的切出来的截面的长轴和短轴各有多长,不知道能不能实现?谢谢各位老师


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发表于 Post on 2018-8-17 13:47:08 | 只看该作者 Only view this author
我刚才又对程序作了更新,目前可以把边缘格点导出成pdb文件,在VMD里随意测量,例如


相应地,之前的帖子http://bbs.keinsci.com/thread-9331-1-1.html也已经更新了

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2018-8-17 10:46:25 | 只看该作者 Only view this author
我刚刚更新了Multiwfn,去主页上重新下载3.6(dev)版,此版本对域进行积分,会有以下输出
Volume:  317.232000 Bohr^3  (   47.008943 Angstrom^3 )
Average:    0.1000000000E+01
Maximum:    0.1000000000E+01   Minimum:    0.1000000000E+01

Position statistics for coordinates of domain points (Angstrom):
X minimum:   -2.7823  X maximum:    3.1445  Span:    5.9268  
Y minimum:   -2.6823  Y maximum:    2.6095  Span:    5.2918
Z minimum:   -3.1770  Z maximum:    3.9140  Span:    7.0910  <-此即Z方向孔洞的长度

如果这不是你需要的数据,最好能在图上标注一下具体需要哪个距离
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