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[Gaussian/gview] Gaussian势能面扫描问题

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本帖最后由 lijiaqi 于 2018-9-4 08:36 编辑

[url=]acs.jpcc.8b05105.pdf[/url]对于文献中势能面柔性扫描,我用关键词#p opt=modredundant m06/6-31g(d,p)   
末尾设置二面角变化 13 29 30 32 S 6 30.0
为什么在高斯view中 result 里scan是不可以打开的?请问这种图是怎样做出的,非常感谢
刚性扫描scan结果就可以。谢谢指导


acs.jpcc.8b05105.pdf

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-20 14:48:33 | 只看该作者 Only view this author
秦宁 发表于 2020-12-18 21:48
您好,我看您之前咨询过做完柔性扫描后无法查看scan图,后面有解决吗,可以告诉我一下吗?

我自己做扫描,关键词相同,使用笛卡尔坐标,正常结束且可以查看扫描结果

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发表于 Post on 2020-12-18 21:48:39 | 只看该作者 Only view this author
您好,我看您之前咨询过做完柔性扫描后无法查看scan图,后面有解决吗,可以告诉我一下吗?

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发表于 Post on 2018-12-27 09:59:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-25 01:03
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

好的,我试试

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发表于 Post on 2018-12-25 01:03:46 | 只看该作者 Only view this author
Regina 发表于 2018-12-24 10:53
请问你们有做过激发态氢键键长的势能面扫描的吗,总是出现l502错误,是怎么回事呢?

解决SCF不收敛问题的方法
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北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2018-12-24 10:53:45 | 只看该作者 Only view this author
请问你们有做过激发态氢键键长的势能面扫描的吗,总是出现l502错误,是怎么回事呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-4 08:38:07 | 只看该作者 Only view this author
三石草祭 发表于 2018-9-3 12:07
四个构象需要手动调整二面角优化,给体和受体面面分布的有两个,垂直分布的有两个,关于你说的柔性扫描无 ...

好的,非常感谢,我去看下过渡态知识,麻烦你再帮忙看下柔性扫描,文件已上传。谢谢

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发表于 Post on 2018-9-3 12:07:51 | 只看该作者 Only view this author
lijiaqi 发表于 2018-9-3 11:12
请问TS是什么方式呢?非常感谢

四个构象需要手动调整二面角优化,给体和受体面面分布的有两个,垂直分布的有两个,关于你说的柔性扫描无法读取的问题,可以上传输出文件。关于过渡态的知识,可以参照sob老师的帖子http://sobereva.com/44
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-3 11:12:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-3 10:24
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),给你 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-3 11:12:13 | 只看该作者 Only view this author
三石草祭 发表于 2018-9-3 09:57
正如楼上两位师兄所说的,先找到这四个构象,然后寻找两个构象之间的过渡态,不过在寻找过渡态时,和楼主想 ...

请问TS是什么方式呢?非常感谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-3 11:11:10 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2018-9-3 09:47
这个图应该不是柔性扫描出来的。
和楼上所说,是先找出四个构型,然后找的过渡态好像是。

谢谢,文章说是做了柔性扫描,我想再问下柔性扫描我的关键词没有问题,最终也正常结束,但是在高斯view看不到,这个是怎么出错了?谢谢师兄

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-3 11:08:37 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2018-9-3 09:01
算出四种构象,然后找到对应构象之间转化的过渡态即可作出此图

好的,谢谢,请问最初四种构想怎么确定呢?自己固定的二面角吗?过渡态要怎么去找呢?非常感谢

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发表于 Post on 2018-9-3 10:24:22 | 只看该作者 Only view this author
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),给你改了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-9-3 09:57:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 三石草祭 于 2018-9-3 09:58 编辑
小范范1989 发表于 2018-9-3 09:47
这个图应该不是柔性扫描出来的。
和楼上所说,是先找出四个构型,然后找的过渡态好像是。
正如楼上两位师兄所说的,先找到这四个构象,然后寻找两个构象之间的过渡态,不过在寻找过渡态时,和楼主想的一致,进行了柔性扫描的方式,大概确定了过渡态的位置,然后通过TS的方式得到,寻找过渡态,初猜结构是关键,柔性扫描可以很好的帮助你找到这个结构
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发表于 Post on 2018-9-3 09:47:36 | 只看该作者 Only view this author
这个图应该不是柔性扫描出来的。
和楼上所说,是先找出四个构型,然后找的过渡态好像是。
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