请教 electronic coupling (电子耦合) 的计算

吃啥 · 发表于 Post on 2018-11-6 17:08:11

各位老师，同学，我想请教一下关于对于electronic coupling 的计算方法。如帅老师文章J. Mater. Chem. C, 2016, 4, 4546--4555中关于电子耦合的计算，这个结果什么怎么算出的，需要用到什么样的结果分析软件D:\a.png

木秀沙堆 · 发表于 Post on 2020-4-7 13:33:31

yjmaxpayne 发表于 2020-3-18 15:50
走一遍手册里面的例子吧，Alq3的那个不错。ctp的可能有些老，建议看xtp的教程，比较新。既可以搞定激发 ...

请问楼主，xtp的manul链接失效，你有相应的文件吗？麻烦了

木秀沙堆 · 发表于 Post on 2020-3-18 16:54:59

yjmaxpayne 发表于 2020-3-18 15:50
走一遍手册里面的例子吧，Alq3的那个不错。ctp的可能有些老，建议看xtp的教程，比较新。既可以搞定激发 ...

好的好的，多谢

yjmaxpayne · 发表于 Post on 2020-3-18 15:50:42

本帖最后由 yjmaxpayne 于 2020-3-18 16:00 编辑

木秀沙堆发表于 2020-3-18 11:33
q请问楼主，Votca软件找到了，但我好像无头绪，怎么使用。可以告知12吗

走一遍手册里面的例子吧，Alq3的那个不错。ctp的可能有些老，建议看xtp的教程，比较新。既可以搞定激发态，又可以搞定基态的传输。

木秀沙堆 · 发表于 Post on 2020-3-18 11:33:53

yjmaxpayne 发表于 2018-11-7 15:46
有多种选择：1) J_from_G03 2) ADF 3) VOTCA CTP
我自己较常用的是VOTCA CTP

q请问楼主，Votca软件找到了，但我好像无头绪，怎么使用。可以告知12吗

TDHFjiang · 发表于 Post on 2018-12-21 09:36:33

让你变成回忆发表于 2018-11-8 09:32
目前我正在写一个基于Gaussian的输出结果，利用格点能修正方法计算转移积分的程序，已经写完了，正在做一 ...

非常期待

yjmaxpayne · 发表于 Post on 2018-11-13 14:03:01

吃啥发表于 2018-11-13 10:43
已经成功了，真的太感谢了

不客气

吃啥 · 发表于 Post on 2018-11-13 10:43:11

yjmaxpayne 发表于 2018-11-12 14:10
错误挺明显的，你的Number of MOs输错了。 Number of MOs填200，然后HOMO (of monomer)填34就行了。或者 ...

已经成功了，真的太感谢了

yjmaxpayne · 发表于 Post on 2018-11-12 14:10:33

本帖最后由 yjmaxpayne 于 2018-11-12 14:13 编辑

吃啥发表于 2018-11-9 19:18
在运行最后一步的时候，出现如下的错误。提示矩阵无法相乘。我看到第四步产生的文件中都是200行和400行。 ...

错误挺明显的，你的Number of MOs输错了。 Number of MOs填200，然后HOMO (of monomer)填34就行了。或者，你在改get_J.m的时候， nbasis = 200 nhomo_mon = 34即可。

吃啥 · 发表于 Post on 2018-11-9 19:18:09

yjmaxpayne 发表于 2018-11-9 17:48
还有一个办法，不用修改源代码，可以把输出文件里面：
400 basis functions, 752 primitive gaussian... ...

在运行最后一步的时候，出现如下的错误。提示矩阵无法相乘。我看到第四步产生的文件中都是200行和400行。不知道是什么原因。

吃啥 · 发表于 Post on 2018-11-9 18:34:44

yjmaxpayne 发表于 2018-11-9 17:48
还有一个办法，不用修改源代码，可以把输出文件里面：
400 basis functions, 752 primitive gaussian... ...

真的可以了，太感谢了。

yjmaxpayne · 发表于 Post on 2018-11-9 17:48:49

吃啥发表于 2018-11-8 22:30
高斯文件的写法我也是按照例子中写，随后处理的命令也没有问题（我用命令运行了作者给出的例子是成功的） ...

还有一个办法，不用修改源代码，可以把输出文件里面：
400 basis functions, 752 primitive gaussian.......
至nuclear repulsion energy ...... 共三行，拷贝到
Two-electron integral symmetry is turned off. 这一行之后

亲测可用。

yjmaxpayne · 发表于 Post on 2018-11-9 17:38:46

吃啥发表于 2018-11-8 22:30
高斯文件的写法我也是按照例子中写，随后处理的命令也没有问题（我用命令运行了作者给出的例子是成功的） ...

大致清楚了，是J_from_G03对G09输出格式兼容有问题，读不出G09的log里面NBasis信息。可能需要对J_from_G03的源代码进行一些修改才行。

吃啥 · 发表于 Post on 2018-11-9 15:12:55

sobereva 发表于 2018-11-9 03:01
如置顶的新人必读贴和论坛首页的公告栏所示，上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传，以节约 ...

好的，谢谢社长。

吃啥 · 发表于 Post on 2018-11-9 15:12:15

yjmaxpayne 发表于 2018-11-9 15:05
我需要你的gjf或者com输入文件。另外，请注意Sob社长的提示。 log有问题的话，把出错部分贴出就好。

刚刚已经按照社长的说明从新上传。谢谢您。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[波函数分析求助] 请教 electronic coupling (电子耦合) 的计算

评分 Rate

浏览过的版块