求助计算锂电池的电解液体系的总能量是正值正确吗

小雨呢喃 · 发表于 Post on 2018-12-24 13:29:36

本帖最后由小雨呢喃于 2018-12-24 13:32 编辑

请问使用amber进行电解液模拟的时候，能量为正值这样正确吗？电解液成分有机分子锂离子硝酸根离子。

小雨呢喃 · 发表于 Post on 2019-1-10 21:10:14

hdmd 发表于 2019-1-8 20:48
分时间段做下扩散系数，看看平衡没有，如果平衡了应该不要紧

好的，谢谢。扩散系数就是粒子的移动速度吧？

hdmd · 发表于 Post on 2019-1-8 20:48:19

小雨呢喃发表于 2018-12-30 16:58
Sob老师，这个是具体的体系，我测试了下静电作用好像主要来自于DME。力场我使用高斯计算然后gaff力场。

分时间段做下扩散系数，看看平衡没有，如果平衡了应该不要紧

小雨呢喃 · 发表于 Post on 2018-12-30 16:58:27

sobereva 发表于 2018-12-30 04:32
按说阴阳离子间的作用应当使得总静电作用能是明显负值才对。没看到你的具体结构不好说。

Sob老师，这个是具体的体系，我测试了下静电作用好像主要来自于DME。力场我使用高斯计算然后gaff力场。

sobereva · 发表于 Post on 2018-12-30 04:32:26

小雨呢喃发表于 2018-12-29 18:23
sob老师，谢谢您的回复，刚看到您的回复。这个EELEC是不是有可能由于有机分子之间的相互作用造成的

按说阴阳离子间的作用应当使得总静电作用能是明显负值才对。没看到你的具体结构不好说。

小雨呢喃 · 发表于 Post on 2018-12-29 18:24:42

本帖最后由小雨呢喃于 2018-12-29 18:59 编辑

hdmd 发表于 2018-12-25 14:26
不是这样的，输出结果中非键相互作用能也是正值，库伦作用是正值，以前做过超临界流体的模拟，高压下能量 ...

谢谢回复，刚刚看到。整个体系是电中性的就是电解液锂离子对应的阴离子有机溶剂。您能说的详细点吗过于场

小雨呢喃 · 发表于 Post on 2018-12-29 18:23:00

sobereva 发表于 2018-12-25 00:45
我没用amber跑过你这类体系，不过EELEC这么正，比较诡异

sob老师，谢谢您的回复，刚看到您的回复。这个EELEC是不是有可能由于有机分子之间的相互作用造成的

hdmd · 发表于 Post on 2018-12-25 14:26:44

本帖最后由 hdmd 于 2018-12-25 14:30 编辑

小雨呢喃发表于 2018-12-24 15:07
谢谢回复。也看到一些帖子说因为总能是成键能和非键能之和，成键能是正值，所以总能可能是正的。只是看 ...

不是这样的，输出结果中非键相互作用能也是正值，库伦作用是正值，以前做过超临界流体的模拟，高压下能量确实大于0，但是这个体系显然不是，难道整个体系不是电中性？实在不行可以考虑把UA力场换个AA力场试一下，这个有点反常规

sobereva · 发表于 Post on 2018-12-25 00:45:35

我没用amber跑过你这类体系，不过EELEC这么正，比较诡异

小雨呢喃 · 发表于 Post on 2018-12-24 15:07:34

本帖最后由小雨呢喃于 2018-12-24 15:09 编辑

fhh2626 发表于 2018-12-24 14:58
能量的绝对值一般没有任何意义

谢谢回复。也看到一些帖子说因为总能是成键能和非键能之和，成键能是正值，所以总能可能是正的。只是看这个值好大，就想是不是有问题。

fhh2626 · 发表于 Post on 2018-12-24 14:58:11

能量的绝对值一般没有任何意义

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