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[综合交流] 怎么通过理论计算定性或者定量比较阴离子的亲核性呢?

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本帖最后由 15whyhq 于 2019-4-16 22:21 编辑

怎么通过理论计算定性或者定量比较阴离子(Cl- OAc-(乙酸根) OTs-(对甲苯磺酸根))的亲核性强弱呢?这些阴离子作为亲核试剂进攻同一底物,计算得到了能垒,能垒的高低与亲核性成反比,是不是通过能垒可以比较出亲核性的强弱?
还可以通过哪些方法或者计算哪些量来证明亲核性的强弱呢?
谢谢。


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-19 23:26:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 15whyhq 于 2019-4-20 16:20 编辑
sobereva 发表于 2019-4-19 23:09
如果简缩福井函数数值不同,三个分别说。那个最大哪个就最可能发生反应

实际在过渡态的中,阴离子脱离配位的金属,三个原子是对称的结构,这个时候简缩福井函数与金属配位的时候应该不一样了吧。

衡量阴离子的亲核能力可以直接用某一个原子的简缩局部软度吗?

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发表于 Post on 2019-4-19 23:09:25 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2019-4-19 23:07
好的,谢谢。比如OTs-阴离子里面有三个原子是同等的可以进攻碳,但是因为与金属配位时,电荷不一样,我算 ...

如果简缩福井函数数值不同,三个分别说。那个最大哪个就最可能发生反应
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-19 23:07:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 15whyhq 于 2019-4-19 23:19 编辑
sobereva 发表于 2019-4-19 22:13
IP、EA通常用eV
福井函数用a.u.

好的,谢谢。比如OTs-阴离子里面有三个原子是同等的可以进攻碳,但是因为与金属配位时,电荷不一样,我算其中一个原子的简缩福井函数是求三个的平均值吗?还是?
或者是可以这样处理吗?把过渡态中的催化剂的结构取出来算不同态(N N-1 N+1)的单点能,算全局软度以及实际进攻碳的原子的电荷来求简缩福井函数;以此横向比较不同阴离子上某原子的进攻碳的亲核能力。

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发表于 Post on 2019-4-19 22:13:16 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2019-4-19 16:05
IP EA f-分别换算成什么单位呢?算出来f-的单位是a.u.?

IP、EA通常用eV
福井函数用a.u.
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-19 17:41:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 15whyhq 于 2019-4-20 16:19 编辑

算完福井函数发现有正值、有负值,怎么处理呢?电荷是计算的Hirshfeld。谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-19 16:05:23 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 15whyhq 于 2019-4-19 16:10 编辑

IP EA f-分别换算成什么单位呢?算出来f-的单位是a.u.?

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发表于 Post on 2019-4-19 03:53:14 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2019-4-18 19:13
针对,IP和EA都用垂直的,结构对阴离子优化
意思是按阴离子原有的价态和自旋多重度优化结构,然后用这个 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-4-19 03:52:51 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2019-4-18 19:46
阴离子优化结构的时候,需要考虑隐式溶剂模型吗?
还有一个问题想确认下,我的这些阴离子都是与金属配位的 ...

考虑
计算整体更严格
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15whyhq 发表于 2019-4-18 20:29
算简缩f-时是不是只要统计阴离子上进攻碳的该原子的电荷,还是整个阴离子的简缩f-?如果是整个阴离子的话怎 ...

简缩福井函数是对于原子而言的,显然应该只考虑参与反应的原子
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-18 20:29:56 | 只看该作者 Only view this author
算简缩f-时是不是只要统计阴离子上进攻碳的该原子的电荷,还是整个阴离子的简缩f-?如果是整个阴离子的话怎么统计的呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-18 19:46:41 | 只看该作者 Only view this author
阴离子优化结构的时候,需要考虑隐式溶剂模型吗?
还有一个问题想确认下,我的这些阴离子都是与金属配位的催化剂,只是找过渡态的时候,是阴离子去进攻碳,这样的话还是计算阴离子就可以了?还是计算整体的催化剂结构呢?谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-18 19:13:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-18 17:41
对于阴离子自己来说,发生的是亲电反应
算f+还是f-是对于自己而言
IP和EA都用垂直的,结构对阴离子优化 ...

针对,IP和EA都用垂直的,结构对阴离子优化
意思是按阴离子原有的价态和自旋多重度优化结构,然后用这个结构算另一个N-1  N+1的单点能,电子能量直接相减得到相应的IP和EA?

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发表于 Post on 2019-4-18 17:41:25 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2019-4-18 10:53
我不明白为什么算的是f-,阴离子不是作为亲核试剂进攻缺电子的底物,发生的不是亲核反应吗?

直接算阴 ...

对于阴离子自己来说,发生的是亲电反应
算f+还是f-是对于自己而言
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发表于 Post on 2019-4-18 17:41:00 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2019-4-18 11:10
计算静电势,也是算阴离子的静电势?

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