请教伞状采样计算团簇自由能

HXTT · 发表于 Post on 2019-4-18 15:50:16

用gromacs+plumed软件计算团簇在生长过程中的自由能图变化，想要将集体变量设置为团簇原子数目，该怎么在plumed输入文件中设置呢？

jimingyu · 发表于 Post on 2020-7-31 15:21:17

你好，我最近也在做这个方向，请问您做出来了吗

HXTT · 发表于 Post on 2019-4-22 10:30:23

fhh2626 发表于 2019-4-19 00:57
没有这样的反应坐标，集合（几何）变量是个可测量的几何量，原子数都是固定的，类似回转半径一类的几何量在 ...

那如果想计算团簇原子数增加过程的自由能图变化有没有其他方法呢，谢谢

fhh2626 · 发表于 Post on 2019-4-19 00:57:56

没有这样的反应坐标，集合（几何）变量是个可测量的几何量，原子数都是固定的，类似回转半径一类的几何量在这种情况下可能有用

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