vasp计算40核比28核慢了一大截

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2019-4-29 09:37:15

本帖最后由灰飞的旋律于 2019-4-29 09:51 编辑

请问下我做VASP计算，HSE泛函算DOS，可是我的双路E5 2673V4（2.3HGz 共40物理核，4根2400MHZ 32G内存条）比双路 E5 2680v4（2.4GHz 共28物理核，8根2400MHZ 8G内存条）计算速度反而慢了一大截呢，迭代一次耗时，也就是LOOP，前者21333秒，后者16545秒，那么实际耗时前者5.9小时，后者4.6小时，40核INCAR里NCORE=5, 28核设置的4.，没有开超线程
请问比较有可能会是哪些原因呢

monk1077 · 发表于 Post on 2020-11-17 10:38:05

内存是否插满，
这两款CPU基频与全核睿频不一样。

biogon · 发表于 Post on 2020-7-7 18:04:51

灰飞的旋律发表于 2019-5-31 20:57
期待明年intel的新CPU架构配合明年新出的DDR5，那带宽，vasp跑GW又可以加速一两倍感觉。外行愚见，欢迎科 ...

过了一年又翻到这个了，带宽和延迟是不可能都占了好的，NAND颗粒再玩延迟也就那样了，想压缩延迟就是傲腾这种下一代解决方案，还有就是在SSD和DRAM中间折中的傲腾DRAM，有大容量的情况下带宽和延迟也找了个平衡点，当然想用内存或者傲腾当硬盘都需要软件深度优化的，现行的计算软件就别想了，根本用不到那些性能

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2019-10-9 21:36:50

Picardo 发表于 2019-10-9 15:11
我觉得是核数太多的原因，楼主试下10核，16核的速度

已经证实是内存带宽的问题了

Picardo · 发表于 Post on 2019-10-9 15:11:45

我觉得是核数太多的原因，楼主试下10核，16核的速度

dutian_007 · 发表于 Post on 2019-6-14 15:44:36

灰飞的旋律发表于 2019-5-31 12:41
又加了四根，总共8根了，够双路四通道了，比原来双路双通道直接减少了40%的耗时。原来NCORE=10,40核用HSE06 ...

看的就是这个结果。

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2019-5-31 20:57:34

本帖最后由灰飞的旋律于 2019-5-31 21:10 编辑

hakuna 发表于 2019-5-31 19:25
看来2673v4表现还是可以的

期待明年intel的新CPU架构配合明年新出的DDR5，那带宽，vasp跑GW又可以加速一两倍感觉。外行愚见，欢迎科普，莫喷

：啥时候NVM的带宽能跟上来，重要的是延迟也解决了，GW+BSE跑点几十个原子的体系不再是梦。话说NVM越来越成熟了，等用在HPC服务器上，像高斯这种高I/O的，基本上直接可以拿内存当硬盘了，到时候算力也得提升一大截

hakuna · 发表于 Post on 2019-5-31 19:25:32

灰飞的旋律发表于 2019-5-31 12:41
又加了四根，总共8根了，够双路四通道了，比原来双路双通道直接减少了40%的耗时。原来NCORE=10,40核用HSE06 ...

看来2673v4表现还是可以的

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2019-5-31 12:41:36

本帖最后由灰飞的旋律于 2019-5-31 12:44 编辑

又加了四根，总共8根了，够双路四通道了，比原来双路双通道直接减少了40%的耗时。原来NCORE=10,40核用HSE06算DOS一步17222秒，现在10251秒

biogon · 发表于 Post on 2019-5-12 20:45:21

灰飞的旋律发表于 2019-5-12 14:45
LGA4189，这是给啥CPU准备的

下一代服务器U

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2019-5-12 14:45:08

本帖最后由灰飞的旋律于 2019-5-12 14:52 编辑

biogon 发表于 2019-5-12 14:19
6132也就能升级白金81xx或者黄金62xx 白金82xx，明年发布的换新接口LGA4189

LGA4189，这是给啥CPU准备的

biogon · 发表于 Post on 2019-5-12 14:21:12

灰飞的旋律发表于 2019-5-9 16:46
我也觉得是，准备插满，我的是ATX主板，只能插8根。那VASP计算是用EATX还是ATX板呢，毕竟前者可以有16个 ...

够四通道就行，再加多了不能增加性能

biogon · 发表于 Post on 2019-5-12 14:19:55

灰飞的旋律发表于 2019-5-9 16:45
三级缓存的影响大不大呢，对于VASP计算来说有多大呢？？我觉得40核还是太多了，内存带宽可能会有点跟不上 ...

6132也就能升级白金81xx或者黄金62xx 白金82xx，明年发布的换新接口LGA4189

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2019-5-9 16:46:00

本帖最后由灰飞的旋律于 2019-5-9 16:47 编辑

biogon 发表于 2019-5-8 10:29
你的内存带宽不够了，四通道双路至少得插8个内存条

我也觉得是，准备插满，我的是ATX主板，只能插8根。那VASP计算是用EATX还是ATX板呢，毕竟前者可以有16个插槽，都插满相对于8插槽能有多大比例提升？？

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2019-5-9 16:45:36

本帖最后由灰飞的旋律于 2019-5-9 16:49 编辑

hakuna 发表于 2019-5-8 10:15
关注2673v4一段时间了，一直觉得应该不错，尤其喜欢它的50MB的cache，刚搜了一下intel官网，竟然没找到这 ...

三级缓存的影响大不大呢，对于VASP计算来说有多大呢？？我觉得40核还是太多了，内存带宽可能会有点跟不上，不知道选个32或者36核的但主频更高的，2.6GHz的，比如2690V4，但这样就不如买金牌6132了，毕竟主频都是比2673高0.3，但6132针脚是最新的，以后还可以升级CPU，就是三级缓存少了一半多，不清楚三级缓存和主频核数带宽这些因素对VASP计算来说哪几个占主要影响？？？如果知道的话，就可以挑选一款特别适合vasp计算的又平衡的CPU了

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