求助在计算频率的时候出现了比较小的虚频求教怎么消除虚频

逝去难追 · 发表于 Post on 2019-5-22 10:42:37

这是我的INCAR

yika · 发表于 Post on 2024-11-25 16:46:35

granvia 发表于 2019-5-28 01:22
我认真看了一下那个VASP教程，其实没有问题，因为他计算得到乙醇的频率有3*9=27个值，其中三个是出现虚数 ...

老师，我明白了，因为最后几个频率对应的是平动和转动自由度，所以对应的能量应该远小于振动能级，所以只要虚频在平动和转动自由度上，且其能量相较于振动能量占比很少即可忽略，上述理解不知道是否有问题，谢谢老师

yika · 发表于 Post on 2024-11-25 16:02:06

granvia 发表于 2019-5-28 01:22
我认真看了一下那个VASP教程，其实没有问题，因为他计算得到乙醇的频率有3*9=27个值，其中三个是出现虚数 ...

老师你好，那这么说是不是不对应振动的虚频无论多大都可以忽略？

hellozhaoming · 发表于 Post on 2024-10-11 16:08:13

sobereva 发表于 2019-5-27 04:02
分子计算，50、100的虚频根本不能随随便便忽略，除非对自己的数据根本不负责任。

1 一方面这已经可能意 ...

我的个人看法：
波数越大的振动越接近局域的谐振子，波数越小的振动谐振子的力常数越接近零，越接近自由平动。波数非常接近零的振动自由度，已经接近于理想自由平动模式了，用简谐近似不合理，但直接忽略也不合理。
如果振动模式是由H、N、O、F元素贡献的，且如果用隐式溶剂模型，比如水溶液，计算振动时并没有考虑振动模式与溶剂氢键网络的耦合。这些接近平动的模式实际上不应该存在，而是与氢键网络的振动耦合，（除非该元素与氢键网络没有相互作用），所以把小波数的振动手动改成水的振动波数可能更合理一些。当然这只是推测，没有严格证明。

红烧肉盖饭 · 发表于 Post on 2023-12-23 09:24:32

老师您好，我目前遇到了消虚频问题。通过jmol软件查看，我的孤立体系计算也存在虚频。具体数据在我的最新论坛博文里。
我一开始想通过jmol可视化，将结构按照虚频旋转的方向保存进行重新优化。但是，我尝试保存失败了。
后续，我又尝试vaspkit的507程序，但是显示说“no imaginary-freq”。告诉我不存在虚频，与vaspkit论坛里，写的也不相同。
或许老师，有没有什么好的消虚频的方式？

我的体系中设置EDIFFG = -0.03，EDIFF = 1E-7，ENCUT = 500

nosugar · 发表于 Post on 2023-7-17 15:22:15

sobereva 发表于 2023-6-27 23:28
得弄清楚造成的原因
诸如优化收敛已经足够精确，但由于CUTOFF太低等数值因素造成Hessian太糙而产生虚频 ...

好的非常谢谢社长！

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-27 23:28:22

nosugar 发表于 2023-6-27 20:49
老师您好，想问一下我在计算一个氧气的吸附体系中，结构优化后计算频率，得到三个虚频都大于50cm-1，那这 ...

得弄清楚造成的原因
诸如优化收敛已经足够精确，但由于CUTOFF太低等数值因素造成Hessian太糙而产生虚频，那不是结构自身的问题
再比如优化时对某些部分做了冻结而导致虚频，那也没法说是不稳定。

nosugar · 发表于 Post on 2023-6-27 20:49:35

sobereva 发表于 2020-1-3 20:36
绝对不能

老师您好，想问一下我在计算一个氧气的吸附体系中，结构优化后计算频率，得到三个虚频都大于50cm-1，那这样的话是证明我的结构不稳定嘛？但是结构优化已经收敛，EDIFFG = -0.02，EDIFF = 1E-5。

Lilunjisuan · 发表于 Post on 2023-6-6 09:14:02

飞翔的猪发表于 2019-5-27 20:53
sob老师，打扰您了，我想请问一下：vasp进行零点能校正计算的时候，对于虚频为多少才可以忽略。

vasp ...

我最近用VASP计算过渡态，过渡态的虚频一直在十几或者二十几 i cm-1 , 如果按照小于50可以忽略的话，我这过渡态是不是就不存在？如果按照虚频不能随意忽略，我这过渡态就算是找到了。用了几种过渡态的方法和插不同的点，可以相互验证，基本就是这个过渡态结构了。不知道怎么判断了？

sobereva · 发表于 Post on 2022-8-12 06:37:08

nemolee 发表于 2022-8-11 22:20
请问Gaussian中计算的小分子这种平动转动的虚频是可以忽略的吗？谢谢。
类似这种：
Low frequencies - ...

可以

nemolee · 发表于 Post on 2022-8-11 22:20:51

sobereva 发表于 2020-1-3 20:36
绝对不能

请问Gaussian中计算的小分子这种平动转动的虚频是可以忽略的吗？谢谢。
类似这种：
Low frequencies --- -4.7750 -3.6574 -0.0018 0.0005 0.0017 2.7154
Low frequencies --- 23.8793 31.3131 42.5335

sige · 发表于 Post on 2020-1-10 15:25:45

卡开发发发表于 2020-1-8 22:43
动能截断。

收到，非常感谢！

卡开发发 · 发表于 Post on 2020-1-8 22:43:24

sige 发表于 2020-1-8 15:20
请教卡老师，怎么增加FFT网格密度呢，增大K点吗

动能截断。

sige · 发表于 Post on 2020-1-8 15:20:29

卡开发发发表于 2019-5-27 20:52
其实我觉得比较莫名其妙的地方还是为啥要区分分子振动和固体振动，还要构造两种不同的标准，如果虚频值正好 ...

请教卡老师，怎么增加FFT网格密度呢，增大K点吗

sobereva · 发表于 Post on 2020-1-3 20:36:22

xxzj 发表于 2020-1-3 19:02
老师，您好，我对分子结构优化后计算了频率，有一个虚频为-0.66，可以忽略吗？

绝对不能

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