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[新手求助] 请各位老师看看我对过渡态搜索和能量的表达是否正确

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楼主
本帖最后由 心辉 于 2019-5-22 16:13 编辑

新手学习过渡态的搜索,学习了一些东西 但是还是有些模棱两可的东西,所以在这里总结一下我的过程,想让各位老师检查一下,看下是否有错误。第一步,
在 B3LYP/6-31G(d)的函数与基组的条件下,优化过渡态与中间体,并做频率分析,判断标准是中间体没有虚频,过渡态有且只有一个虚频。
高斯的关键词是: 中间体-# opt freq b3lyp/6-31g(d)
           过渡态-# opt=(ts,calcfc,noeigen) freq b3lyp/6-31g(d)
然后最后在计算的结果中读取能量:Thermal Correction to Free Energy (标记为E1)
第二步,
在之前计算结构的基础上,用 B3LYP/6-311G(d)的函数与基组下,加上D3校正,与SMD溶剂模型。计算单点能
高斯的关键词是:# b3lyp/6-311g(d) scrf=(smd,solvent=methylbenzene) EmpiricalDispersion=GD3BJ
然后最后在计算的结果中读取能量:HF (标记为E2)


然后最后读取的能量是E3=E1+E2


不知道这要做是不是对的,哪里有错希望各位老师能指出来,谢谢各位老师







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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-26 11:11:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-23 00:29
B3LYP叫泛函不叫函数

加D3算单点没有理由优化不加,仔细看此文

好的 谢谢您的指导

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发表于 Post on 2019-5-23 00:29:13 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP叫泛函不叫函数

加D3算单点没有理由优化不加,仔细看此文
量子化学研究中切换泛函应当注意的问题
http://sobereva.com/415http://bbs.keinsci.com/thread-9878-1-1.html

其它问题在2L提到的文章中有详细说明
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-22 21:20:25 | 只看该作者 Only view this author
Frank 发表于 2019-5-22 18:27
http://sobereva.com/327
看社长的这个帖子,学习分别怎么准确计算气相自由能和溶剂化自由能。

好的 谢谢您

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发表于 Post on 2019-5-22 18:27:57 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/327
看社长的这个帖子,学习分别怎么准确计算气相自由能和溶剂化自由能。
eureka

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