计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 15706|回复 Reply: 24
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 计算conical intersection时的报错该如何解决

[复制链接 Copy URL]

163

帖子

0

威望

1025

eV
积分
1188

Level 4 (黑子)

仿照Exploring-chemistry-with-electric-structure-methods 第二版第九章的Advanced Exercise 9.6计算conical intersection
在计算最后一步的时候遇到了很奇怪的报错
输入文件如下:
%mem=20GB
%nprocshared=32
%chk=4.chk
%oldchk=3.chk
#p CAS(10,10,NRoot=2)/def2TZVP Opt=conical Nosymm iop(1/8=5) guess=read geom=check

4

0 1

0.5 0.5

log文件最后20行信息如下:
  Final State Averaged  Density Matrix
                1             2             3             4             5
      1  0.200000D+01
      2  0.000000D+00  0.200000D+01
      3  0.000000D+00  0.000000D+00  0.200000D+01
      4  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.200000D+01
      5  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.100000D+01
      6  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      7  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      8  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      9  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
     10  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
                6             7             8             9            10
      6  0.100000D+01
      7  0.000000D+00  0.000000D+00
      8  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
      9  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
     10  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00  0.000000D+00
Erroneous write. Write -1 instead of 1906968.
fd = 4
orig len = 1907160 left = 1906968
g_write



而且算得异常缓慢,59k算了六个小时
请问各位大神,这个错误是什么情况??

163

帖子

0

威望

1025

eV
积分
1188

Level 4 (黑子)

25#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-26 17:03:56 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2019-7-26 16:25
单点,不会用STO-3G去优化构型。从小基组到大基组的唯一好处就是更容易找到你需要的活化轨道,如果用大基 ...

谢谢老师,明白了,我去尝试一下。

368

帖子

0

威望

4691

eV
积分
5059

Level 6 (一方通行)

24#
发表于 Post on 2019-7-26 16:25:12 | 只看该作者 Only view this author
Abandon-fmt 发表于 2019-7-26 12:37
不好意思,多次打扰老师了,我还有两个问题,老师有空可以麻烦帮忙解答一下么?
1)从最初的结构优化就 ...

单点,不会用STO-3G去优化构型。从小基组到大基组的唯一好处就是更容易找到你需要的活化轨道,如果用大基组找活化轨道没问题的话,不需要走这个流程。为什么STO-3G更利于选择活化轨道,因为轨道少,在非占据轨道没有一些里德堡轨道干扰你,你测试一下就知道了。你想想在10个轨道里面选5个容易还是在100个轨道里面选5个容易?

163

帖子

0

威望

1025

eV
积分
1188

Level 4 (黑子)

23#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-26 12:38:01 | 只看该作者 Only view this author
Daniel_Arndt 发表于 2019-7-26 08:47
本论坛里面应该有关于活化空间选取的文献,我记得不错的话。

谢谢老师,我找到了那些文献

163

帖子

0

威望

1025

eV
积分
1188

Level 4 (黑子)

22#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-26 12:37:29 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2019-7-26 10:18
不好说,至少大基组的结果明显不合理。从小基组到大基组我见的比较多的是STO-3g-->4-31G-->6-31G这样的, ...

不好意思,多次打扰老师了,我还有两个问题,老师有空可以麻烦帮忙解答一下么?
1)从最初的结构优化就用STO-3G,然后用这个结果进行活性空间的选择?
2)请问“STO-3G基函数少”为什么“非常利于选择活化轨道”?

368

帖子

0

威望

4691

eV
积分
5059

Level 6 (一方通行)

21#
发表于 Post on 2019-7-26 10:18:33 | 只看该作者 Only view this author
Abandon-fmt 发表于 2019-7-26 07:50
小基组是def2SVP,大基组def2TZVP,跨度应该不算大吧?

不好说,至少大基组的结果明显不合理。从小基组到大基组我见的比较多的是STO-3g-->4-31G-->6-31G这样的,svp到tzvp似乎挺大的,而且这样做感觉也没太大意思,STO-3G基函数少,非常利于选择活化轨道,def2-svp已经起不到这个作用了,所以这种情况下def2-tzvp就直接从头开始选轨道吧,不要用svp的结果。

517

帖子

1

威望

2414

eV
积分
2951

Level 5 (御坂)

20#
发表于 Post on 2019-7-26 08:47:55 | 只看该作者 Only view this author
本论坛里面应该有关于活化空间选取的文献,我记得不错的话。

163

帖子

0

威望

1025

eV
积分
1188

Level 4 (黑子)

19#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-26 07:50:02 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2019-7-25 20:31
能量没有,是不是你的基组跨度太大

小基组是def2SVP,大基组def2TZVP,跨度应该不算大吧?

368

帖子

0

威望

4691

eV
积分
5059

Level 6 (一方通行)

18#
发表于 Post on 2019-7-25 20:31:09 | 只看该作者 Only view this author
Abandon-fmt 发表于 2019-7-25 14:31
老师,再打扰一下,请问这个totoal的能量指的是活性空间的能量还是什么能量?这个能量有合理的范围么?
...

能量没有,是不是你的基组跨度太大

368

帖子

0

威望

4691

eV
积分
5059

Level 6 (一方通行)

17#
发表于 Post on 2019-7-25 20:30:01 | 只看该作者 Only view this author
Abandon-fmt 发表于 2019-7-25 13:25
谢谢老师,请问这本书是Exploring chemistry with electric structure methods,第二版么?

第三版

163

帖子

0

威望

1025

eV
积分
1188

Level 4 (黑子)

16#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-25 14:31:05 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2019-7-25 09:39
看上面图片的描述,第一副最下面和第二页最上面。

老师,再打扰一下,请问这个totoal的能量指的是活性空间的能量还是什么能量?这个能量有合理的范围么?
我是拿小基组的结果作为大基组的初猜,小基组算出来的占据数都在0.02-1.98之间,大基组就不是。大基组的能量是-999.502917,小基组的能量是-998.011960,这个数值合理么?

163

帖子

0

威望

1025

eV
积分
1188

Level 4 (黑子)

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-25 13:25:25 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2019-7-25 09:39
看上面图片的描述,第一副最下面和第二页最上面。

谢谢老师,请问这本书是Exploring chemistry with electric structure methods,第二版么?

368

帖子

0

威望

4691

eV
积分
5059

Level 6 (一方通行)

14#
发表于 Post on 2019-7-25 09:39:11 | 只看该作者 Only view this author
Abandon-fmt 发表于 2019-7-24 08:34
老师不好意思,没大看懂“检查活化空间是否合理的一个标准就是占据轨道占据数不能接近2,非占据轨道占据 ...


看上面图片的描述,第一副最下面和第二页最上面。



163

帖子

0

威望

1025

eV
积分
1188

Level 4 (黑子)

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-24 08:34:16 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2019-7-22 21:34
你的活化空间肯定有问题,除了HOMO和LUMO的占据数是1,其他占据轨道的占据数是2,非占据轨道的占据数是0 ...

老师不好意思,没大看懂“检查活化空间是否合理的一个标准就是占据轨道占据数不能接近2,非占据轨道占据数不能接近0”这句话,为什么活化空间占据轨道占据数不能接近2,非占据轨道占据数不能接近0?
还有个问题,怎么判断占据轨道占据数和非占据轨道占据数?

再次感谢老师的指导!

368

帖子

0

威望

4691

eV
积分
5059

Level 6 (一方通行)

12#
发表于 Post on 2019-7-22 21:34:10 | 只看该作者 Only view this author
Abandon-fmt 发表于 2019-7-22 13:43
请问老师,这一步我跑了三天,结果只有1M,log文件的信息是这样的:
  Final State Averaged  Density Mat ...

你的活化空间肯定有问题,除了HOMO和LUMO的占据数是1,其他占据轨道的占据数是2,非占据轨道的占据数是0,说明这些轨道都不应该包含在活化空间里面,检查活化空间是否合理的一个标准就是占据轨道占据数不能接近2,非占据轨道占据数不能接近0

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 07:06 , Processed in 0.196990 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list