计算EPR谱图用easyspin结合ORCA，打不开ORCA的输出文件求助

Lakersruobai · 发表于 Post on 2019-7-25 01:11:23

老师您好，我看到之前的帖子您说计算EPR谱图用easyspin结合ORCA，我的orca2easyspin似乎打不开ORCA的输出文件，不知问题在哪，能否请您帮忙解答一下？

奥利奥老东西 · 发表于 Post on 2026-1-30 08:23:50

Lakersruobai 发表于 2019-7-26 11:26
谢谢，已经解决了！

你好，请问一下是怎么解决的

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-5-6 15:44:48

nianbin 发表于 2023-5-5 14:18
好的，谢谢chem哥。话说这个计算好慢，matlaba跑了一个小时了快还没出图

可以人为删掉那些极其小、肯定不会影响图谱的A值

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2023-5-6 12:03:07

nianbin 发表于 2023-5-6 11:29
请问是如何设置考虑几个电荷呀

是考虑计算的原子数，不是电荷，先看分子中哪些位置自旋密度大，然后选择自旋密度较大区域的磁性原子去用ORCA计算

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-6 11:29:11

QuantumicGuy 发表于 2023-5-6 09:15
不至于吧，是不是你算的原子数太多了，考虑四五个原子就行了（自旋密度大且是磁性核）

请问是如何设置考虑几个电荷呀

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2023-5-6 09:15:54

nianbin 发表于 2023-5-5 21:18
好的，谢谢chem哥。话说这个计算好慢，matlaba跑了一个小时了快还没出图

不至于吧，是不是你算的原子数太多了，考虑四五个原子就行了（自旋密度大且是磁性核）

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-5 21:18:40

wzkchem5 发表于 2023-5-5 20:56
这个无所谓，可能因为orca输出文件的有效数字太少，导致本来应该正交的矩阵不是严格正交的。会对结果引入 ...

好的，谢谢chem哥。话说这个计算好慢，matlaba跑了一个小时了快还没出图

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-5-5 20:56:05

nianbin 发表于 2023-5-5 12:54
请问各位老师，我orca2easyspin的时候出现如下报错；是什么情况呀

这个无所谓，可能因为orca输出文件的有效数字太少，导致本来应该正交的矩阵不是严格正交的。会对结果引入一定误差，但是误差可以忽略

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-5 19:54:18

请问各位老师，我orca2easyspin的时候出现如下报错；是什么情况呀

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-5-5 17:32:21

nianbin 发表于 2023-5-5 10:12
现在是这样子，请问该如何获得图谱呀

抱歉我看你回的是我说如何导出成csv的帖子，就理解错你的意思了。
easyspin的在线手册里写了应该怎么做，我手头没有链接，你搜一下easyspin就找到了

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-5 17:12:25

现在是这样子，请问该如何获得图谱呀

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-5 17:11:42

wzkchem5 发表于 2023-5-5 17:00
这种问题不用问人，自己搜一下怎么把csv文件导入origin就知道了。
有的进阶一点的问题，可能只有谷歌才 ...

不是我的意思是我easyspin现在可以正确读取orca的数据了，但是不能显示图谱，我应该如何拟合得到图谱

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-5-5 17:00:13

nianbin 发表于 2023-5-5 09:39
chem哥，请问我正确读取数据了，如何获得图谱呀

这种问题不用问人，自己搜一下怎么把csv文件导入origin就知道了。
有的进阶一点的问题，可能只有谷歌才能搜出合理的答案，那还可以以用不了谷歌为由问人；但是这种问题显然是即使百度都可以搜出靠谱答案的

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-5 16:39:50

wzkchem5 发表于 2020-12-10 10:33
dlmwrite('xxx.csv',');
导出成csv格式，可以用origin读取。

chem哥，请问我正确读取数据了，如何获得图谱呀

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-5 16:35:30

那丢失的发表于 2020-12-10 10:07
你好，我得到图了，但是不知道如何保存为数据点表，这样就没办法用origin作图了

请问下我正确读取数据了如何获得图谱呀

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