高斯输入文件中的geom=connectivity有什么用？

暖玉生烟 · 发表于 Post on 2015-7-14 20:42:27

最近优化同一个物质，因为之前一直把geom=connectivity和最后的那些数字都删掉了也没在意今天偶然听说geom=connectivity可以不删，所以就保留了geom=connectivity和最后的数字，但是

输出文件相差好多，尤其是偶极矩、HOMO、LUMO及一些元素的电荷相差的实在是不能忽略。

看了一下，两个都收敛，个人想知道那种计算是比较官方的，或者说更准确的？计算化学界的沫沫，在此恳求大神帮帮忙

感激不尽！！拜托~~~

yangyinuo823 · 发表于 Post on 2017-1-6 10:30:57

谢谢sob!

sobereva · 发表于 Post on 2016-12-30 12:52:54

yangyinuo823 发表于 2016-12-30 12:29
抱歉写错了，不是坐标，坐标后面的数字没删，数字后面有混合基组的信息

那一串叫连接关系
对于使用了gen的情况，连接关系和geom=connectivity要么都有要么都没有

yangyinuo823 · 发表于 Post on 2016-12-30 12:29:13

yangyinuo823 发表于 2016-12-30 12:26
sob你好，我算的时候保留了geom=connectivity, 后面的坐标也没删，但是坐标后面有混合基组的信息，请问这 ...

抱歉写错了，不是坐标，坐标后面的数字没删，数字后面有混合基组的信息

yangyinuo823 · 发表于 Post on 2016-12-30 12:26:59

本帖最后由 yangyinuo823 于 2016-12-30 12:30 编辑

sobereva 发表于 2015-7-14 23:37
写了geom=connectivity就会从输入文件末尾读取连接关系，所以末尾那一堆连接关系不能删，否则必报错。

...

sob你好，我算的时候保留了geom=connectivity, 后面的数字也没删，但是数字后面有混合基组的信息，请问这样会影响计算结果吗？我一直都是这么算的所以有些担心，谢谢！

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-8-6 14:30:10

sobereva 发表于 2015-7-17 09:55
基组一个6-31+G**，一个6-31G**，当然结果不同

这。。。我还专门去试了一下发现就是一样的，简直了~~

暖玉生烟 · 发表于 Post on 2015-7-17 11:27:25

sobereva 发表于 2015-7-17 09:55
基组一个6-31+G**，一个6-31G**，当然结果不同

当时选的时候都选那个+号了，没发现一个没选中，原来问题在这，我知道了，终于可以开始计算了

谢谢sob老师

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-17 09:55:23

暖玉生烟发表于 2015-7-17 09:21
删除geom和未删除geom的输入和输出文件都传上去了，麻烦了sob老师~~谢谢！

基组一个6-31+G**，一个6-31G**，当然结果不同

暖玉生烟 · 发表于 Post on 2015-7-17 09:21:46

sobereva 发表于 2015-7-17 03:01
这么说不清楚。
输入输出文件压缩后传上来。
偶极矩都不一样总能量绝对不可能一样（除非你比较了偶极 ...

删除geom和未删除geom的输入和输出文件都传上去了，麻烦了sob老师~~谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-17 03:01:16

暖玉生烟发表于 2015-7-16 18:12
能量就是一样，偶极矩，HOMO,LUMO都相差很大，其实我不知道怎么看问题出在哪里，以前计算完我只是把里面 ...

这么说不清楚。
输入输出文件压缩后传上来。
偶极矩都不一样总能量绝对不可能一样（除非你比较了偶极矩的分量，这和朝向有关），肯定是数值读取得不合理。

暖玉生烟 · 发表于 Post on 2015-7-16 18:12:00

sobereva 发表于 2015-7-16 18:01
你应当仔细比较输出文件，看到底什么因素造成了不同。

其它参数不一样则能量也一定不一样，比如不可能 ...

能量就是一样，偶极矩，HOMO,LUMO都相差很大，其实我不知道怎么看问题出在哪里，以前计算完我只是把里面我要的参数数据提取出来

我以为加和不加geom会有一个优化更细致一点，所以想选一个更优化的方法。

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-16 18:01:01

暖玉生烟发表于 2015-7-16 17:52
可是我用两种计算得出的结果，就最终能量一样，其他的好多参数都是不一样的现在不知道选哪个好一点{: ...

你应当仔细比较输出文件，看到底什么因素造成了不同。

其它参数不一样则能量也一定不一样，比如不可能结构不同而恰好能量一样。

暖玉生烟 · 发表于 Post on 2015-7-16 17:52:37

sobereva 发表于 2015-7-15 23:03
没有可靠或者不可靠之说，都一样，不影响结果

可是我用两种计算得出的结果，就最终能量一样，其他的好多参数都是不一样的

现在不知道选哪个好一点

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-15 23:03:17

暖玉生烟发表于 2015-7-15 20:09
一般情况下，我说一般哈，加和不加geom哪个的优化结果更可靠一点点

没有可靠或者不可靠之说，都一样，不影响结果

暖玉生烟 · 发表于 Post on 2015-7-15 20:09:42

vegetable 发表于 2015-7-15 10:46
我记得我试过删除和未删除两种，优化出来的构型还是会有所不同，直接体现在后续激发态计算和优化激发态计算 ...

一般情况下，我说一般哈，加和不加geom哪个的优化结果更可靠一点点

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