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[综合交流] 计算AIMD跑出来的某一帧结构的单点能的问题

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楼主
请问大神
想在高精度基组下计算这个结构的能量,
还有必要以这个结构为基础重新进行结构优化(opt)吗?
谢谢指导!


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-2-22 18:10:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-2-22 17:52
MD过程中由于有热运动,不可能某一帧恰好落到极小点。如果你想证明某一帧结构是在某个极小点附近,并且想 ...

明白了,谢大神指导!
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发表于 Post on 2020-2-22 17:52:08 | 只看该作者 Only view this author
captain 发表于 2020-2-21 20:20
还想请问大神,
AIMD跑出来的某一帧结构还需要做频率分析以证明是能量极小点结构吗?
如果需要的话,是 ...

MD过程中由于有热运动,不可能某一帧恰好落到极小点。如果你想证明某一帧结构是在某个极小点附近,并且想得到这个极小点的确切位置,就需要优化并做振动分析。
对MD过程产生的结构直接做振动分析没有任何意义。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-2-21 20:20:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-10-9 22:41
看具体目的,若无特殊必要不需要优化。如果你的目的是靠AIMD进行势能面采样,之后算极小点结构的目的则需要 ...

还想请问大神,
AIMD跑出来的某一帧结构还需要做频率分析以证明是能量极小点结构吗?
如果需要的话,是直接以当前结构做频率分析,还是在当前结构的基础上重新优化再对优化结构做频率分析?
十分感谢!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-9 22:57:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-10-9 22:41
看具体目的,若无特殊必要不需要优化。如果你的目的是靠AIMD进行势能面采样,之后算极小点结构的目的则需要 ...

明白了 谢大神!
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发表于 Post on 2019-10-9 22:41:20 | 只看该作者 Only view this author
看具体目的,若无特殊必要不需要优化。如果你的目的是靠AIMD进行势能面采样,之后算极小点结构的目的则需要优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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