给Gromacs动力学增加一块显卡？求推荐！

lao7 · 发表于 Post on 2019-11-27 13:20:33

机器自己买零件组装的。配置是CPU 2680 v3，内存128G。目前跑分子动力学太慢！想加块显卡？请问跑Gromacs什么显卡合适？显卡需要和计算机CPU兼容吗？真心不懂显卡的问题。

ChaosChiao · 发表于 Post on 2019-12-25 13:59:37

wuzhiyi 发表于 2019-11-28 07:35
MD不跑replicate exchange不需要多显卡
gromacs两块显卡速度比一块慢，只有三块并行才比一块稍微快一点。
...

amber支持多卡并行，并且官网给出的并行结果效率还可以

lao7 · 发表于 Post on 2019-11-28 18:59:10

买了铭瑄 2070 super 谢谢各位！

wuzhiyi · 发表于 Post on 2019-11-28 07:35:49

MD不跑replicate exchange不需要多显卡
gromacs两块显卡速度比一块慢，只有三块并行才比一块稍微快一点。
amber根本不支持多显卡并行。
NAMD虽然多显卡scale比较好，但要装几块显卡才赶得上gromacs一块显卡的速度。

反之做replicate exchange的话，必须要多显卡，而且8块起跳。

sobereva · 发表于 Post on 2019-11-27 22:16:23

lao7 发表于 2019-11-27 21:47
要几块显卡？两块吗？

GTX780和这个价位差不多，哪款更合适些？谢谢

GTX780早停产了
一块卡就够了，预算不多就2060 Super，预算多就2070 super或2080

lao7 · 发表于 Post on 2019-11-27 21:49:01

qinzhong605 发表于 2019-11-27 13:52
映众或者耕升的RTX 2060s就够用了，没必要买更好的。我手上有2080，跑gmx也仅仅比2060快不到20%（也有可能 ...

一般你跑多长时间？我设置的300ns, 没有显卡。跑完要5天！愁死了！不知道是不是设置时间过长了。

lao7 · 发表于 Post on 2019-11-27 21:47:53

qinzhong605 发表于 2019-11-27 13:52
映众或者耕升的RTX 2060s就够用了，没必要买更好的。我手上有2080，跑gmx也仅仅比2060快不到20%（也有可能 ...

要几块显卡？两块吗？

GTX780和这个价位差不多，哪款更合适些？谢谢

qinzhong605 · 发表于 Post on 2019-11-27 13:52:59

映众或者耕升的RTX 2060s就够用了，没必要买更好的。我手上有2080，跑gmx也仅仅比2060快不到20%（也有可能设置问题）。

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