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[配置讨论] 给Gromacs动力学增加一块显卡?求推荐!

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发表于 2019-11-27 13:20:33 | 显示全部楼层 |阅读模式
机器自己买零件组装的。配置是CPU 2680 v3,内存128G。目前跑分子动力学太慢!想加块显卡?请问跑Gromacs什么显卡合适?显卡需要和计算机CPU兼容吗?真心不懂显卡的问题。

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发表于 2019-11-27 13:52:59 | 显示全部楼层
映众或者耕升的RTX 2060s就够用了,没必要买更好的。我手上有2080,跑gmx也仅仅比2060快不到20%(也有可能设置问题)。

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 楼主| 发表于 2019-11-27 21:47:53 | 显示全部楼层
qinzhong605 发表于 2019-11-27 13:52
映众或者耕升的RTX 2060s就够用了,没必要买更好的。我手上有2080,跑gmx也仅仅比2060快不到20%(也有可能 ...

要几块显卡?两块吗?

GTX780和这个价位差不多,哪款更合适些?谢谢

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 楼主| 发表于 2019-11-27 21:49:01 | 显示全部楼层
qinzhong605 发表于 2019-11-27 13:52
映众或者耕升的RTX 2060s就够用了,没必要买更好的。我手上有2080,跑gmx也仅仅比2060快不到20%(也有可能 ...

一般你跑多长时间?我设置的300ns, 没有显卡。跑完要5天!愁死了!不知道是不是设置时间过长了。

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发表于 2019-11-27 22:16:23 | 显示全部楼层
lao7 发表于 2019-11-27 21:47
要几块显卡?两块吗?

GTX780和这个价位差不多,哪款更合适些?谢谢

GTX780早停产了
一块卡就够了,预算不多就2060 Super,预算多就2070 super或2080
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发表于 2019-11-28 07:35:49 | 显示全部楼层
MD不跑replicate exchange不需要多显卡
gromacs两块显卡速度比一块慢,只有三块并行才比一块稍微快一点。
amber根本不支持多显卡并行。
NAMD虽然多显卡scale比较好,但要装几块显卡才赶得上gromacs一块显卡的速度。

反之做replicate exchange的话,必须要多显卡,而且8块起跳。

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 楼主| 发表于 2019-11-28 18:59:10 | 显示全部楼层
买了 铭瑄 2070 super 谢谢各位!

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发表于 2019-12-25 13:59:37 | 显示全部楼层
wuzhiyi 发表于 2019-11-28 07:35
MD不跑replicate exchange不需要多显卡
gromacs两块显卡速度比一块慢,只有三块并行才比一块稍微快一点。
...

amber支持多卡并行,并且官网给出的并行结果效率还可以
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