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[量化理论] 求助-算单态自由基的反应过程方法基组比较

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本帖最后由 风飞 于 2019-12-19 16:40 编辑

各位老师,大家好,
我利用def2TZVPP empiricaldispersion=gd3 m062x 计算单态自由基的反应过程中(过渡态,中间体,反应能垒和速率常数):审稿人发现在另外类似体系文章中用的方法和基组是:M06–2X/augcc-
pVTZ计算进行优化,并且使用CCSD(T)计算单点,审稿人问我这种方法和之前的方法相比有什么优势,请问这个该怎么回答合适呢?是否可以说,在精度满足的情况下,计算速度快呢?,对于类似体系,我也有看到用B3LYP-D3/6-311+G(2df,2p)进行优化,然后用MP2计算单点


谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-19 20:48:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-19 18:44
def2-TZVPP尚且要花那么长,aug-cc-pVTZ你根本不可能算得动
def2-TZVPP近似等于cc-pVTZ,如果弥散函数不 ...

好的 谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-19 20:48:13 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2019-12-19 17:30
采用你能算的、适合CCSD(T)的基组,不必追求和优化一致。
当然得写基组,不写基组默认是STO-3G

好的  谢谢老师

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发表于 Post on 2019-12-19 18:44:50 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2019-12-19 17:52
嗯,谢谢老师,我没有采用CCSD(T,T1diag)/aug-cc-pVTZ 计算单点,而采用的是CCSD(T,T1diag)/def2TZVPP  ...

def2-TZVPP尚且要花那么长,aug-cc-pVTZ你根本不可能算得动
def2-TZVPP近似等于cc-pVTZ,如果弥散函数不是必需的情况,结果当然可以用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-19 17:52:12 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2019-12-19 17:30
采用你能算的、适合CCSD(T)的基组,不必追求和优化一致。
当然得写基组,不写基组默认是STO-3G

嗯,谢谢老师,我没有采用CCSD(T,T1diag)/aug-cc-pVTZ 计算单点,而采用的是CCSD(T,T1diag)/def2TZVPP 计算的单点,这样可以吗?因为我之前在采用CCSD(T,T1diag)/def2TZVPP 计算时,每个基本都要花上>16h,用CCSD(T,T1diag)/aug-cc-pVTZ 计算单点时间会更长,

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发表于 Post on 2019-12-19 17:31:01 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2019-12-1 19:33
谢谢老师,有两个审稿人,有个说是CCSDT,有个说是CCSDT,   那我这边在用CCSD(T)做个单点,

"有个说是CCSDT,有个说是CCSDT"没看懂

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发表于 Post on 2019-12-19 17:30:35 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2019-12-19 16:29
老师,您好,我的结构优化时在m062x-D3/def2TZVPP 下进行优化的,根据您说的用CCSD(T) 计算单点,那么采 ...

采用你能算的、适合CCSD(T)的基组,不必追求和优化一致。
当然得写基组,不写基组默认是STO-3G

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-19 16:29:01 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2019-11-29 17:36
精度上没啥优势,M06-2X/aug-cc-pVTZ的唯一缺点是太浪费了。只能说虽然精度没有它高,但是也够用。如果愿意 ...

老师,您好,我的结构优化时在m062x-D3/def2TZVPP 下进行优化的,根据您说的用CCSD(T) 计算单点,那么采用的基组是def2TZVPP, 还是aug-cc-pVTZ? 我尝试了直接写CCSD(T) 不写基组情况下得到的能量和CCSD(T) /def2TZVPP得到的能量以及CCSD(T) /aug-cc-pVTZ得到的能量都不一样。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-1 19:33:34 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2019-11-29 17:36
精度上没啥优势,M06-2X/aug-cc-pVTZ的唯一缺点是太浪费了。只能说虽然精度没有它高,但是也够用。如果愿意 ...

谢谢老师,有两个审稿人,有个说是CCSDT,有个说是CCSDT,   那我这边在用CCSD(T)做个单点,

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-1 19:30:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-30 00:43
又是审稿人不懂还瞎找茬

你当前的级别完全没问题,提升到aug-cc-pVTZ优化纯粹是瞎浪费时间,几乎没有任 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2019-11-30 00:43:27 | 只看该作者 Only view this author
又是审稿人不懂还瞎找茬

你当前的级别完全没问题,提升到aug-cc-pVTZ优化纯粹是瞎浪费时间,几乎没有任何可查觉的改进。本来几何优化就对基组很不敏感,甚至def-TZVP都已经完全够了。

看此文
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva.com/387http://bbs.keinsci.com/thread-6600-1-1.html

如果审稿人就是说的CCSDT,而不是你把CCSD(T)写成了CCSDT,说明审稿人连基本理论计算常识都没有。CCSDT多数情况下结果反倒还不如CCSD(T),而耗时多一个数量级以上,Gaussian、ORCA等大多数量化程序还不支持。看
各种后HF方法精度简单横测
http://sobereva.com/378http://bbs.keinsci.com/thread-6005-1-1.html

6-311+G(2df,2p)用于优化是非常烂的选择,本身这个档次的基组就没有存在意义(远不如用ma-TZVP、def2-TZVP),普通泛函做优化根本没必要f极化。
用MP2算单点简直是有病,干出这种事说明作者连MP2和DFT的相对精度关系好坏都不懂,仔细看此文的相关内容了解常识
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

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发表于 Post on 2019-11-29 17:36:28 | 只看该作者 Only view this author
精度上没啥优势,M06-2X/aug-cc-pVTZ的唯一缺点是太浪费了。只能说虽然精度没有它高,但是也够用。如果愿意补的话,可以CCSD(T)或DLPNO-CCSD(T)补个单点,这样就可以说精度差不多,你的级别还更匹配、不浪费。

CCSD(T)还是CCSDT写清楚。
不要用MP2做这个目的。

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