求助：基于multiwfn产生的cube文件以及vmd软件如何画多层次的电子轨道示意图？

gongx · 发表于 Post on 2020-3-4 16:05:49

基于multiwfn产生的cube文件以及vmd软件如何画多层次的电子轨道或电子密度示意图？具体形式如附件图片。原理上是画四层isosurface, 从内向外，每层的透明度不同，比如80%， 60%， 40%，20% 。请问具体如何在vmd中实现？

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-15 05:24:26

yiwei 发表于 2021-3-14 12:19
谢谢社长大人，已找到原因…（渲染下就好

只要你开了GLSL，不需要渲染就能直接看到这个效果
不开GLSL的话是看不到真实的透明的效果的

yiwei · 发表于 Post on 2021-3-14 12:19:24

sobereva 发表于 2021-3-14 02:59
没有tcl。基本过程这里说了

谢谢社长大人，已找到原因…（渲染下就好

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-14 02:59:31

yiwei 发表于 2021-3-13 10:18
社长大人，想提个不情之请，可否把您画这张图的tcl（发给俺学习一下，多次尝试没有成功可能是哪个参数搞 ...

没有tcl。基本过程这里说了

yiwei · 发表于 Post on 2021-3-13 10:18:26

sobereva 发表于 2020-3-5 02:05
graphics - representation里设多个rep，都用透明等值面方式显示，每个rep的isovalue设为不同。不需要单独 ...

社长大人，想提个不情之请，可否把您画这张图的tcl（发给俺学习一下，多次尝试没有成功可能是哪个参数搞错了

sobereva · 发表于 Post on 2020-3-5 02:05:06

graphics - representation里设多个rep，都用透明等值面方式显示，每个rep的isovalue设为不同。不需要单独设不同透明度，叠加次数越多自然颜色就会越深。
整体透明度可以在graphics - materials里改相应材质的opacity

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